150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01473 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00546  transposase  99.09 
 
 
209 aa  228  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06783  hypothetical protein  99.09 
 
 
209 aa  228  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01473  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  227  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08192  transposase  99.09 
 
 
347 aa  227  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01926  hypothetical protein  99.09 
 
 
347 aa  227  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02006  hypothetical protein  99.09 
 
 
347 aa  227  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05219  hypothetical protein  99.09 
 
 
347 aa  227  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02817  hypothetical protein  98.18 
 
 
209 aa  226  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06775  hypothetical protein  97.27 
 
 
206 aa  225  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02808  hypothetical protein  98.18 
 
 
122 aa  224  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05058  hypothetical protein  98.18 
 
 
122 aa  224  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06439  hypothetical protein  98.18 
 
 
122 aa  224  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  85.19 
 
 
347 aa  192  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  85.19 
 
 
347 aa  192  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  85.19 
 
 
347 aa  192  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.26 
 
 
347 aa  191  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4722  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.26 
 
 
347 aa  191  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00618  ISGsu4, transposase  79.63 
 
 
329 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01463  hypothetical protein  96.25 
 
 
93 aa  159  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1833  Heme exporter protein CcmA  63.89 
 
 
377 aa  152  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3462  ISGsu4, transposase  63.89 
 
 
377 aa  152  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0104746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2346  arginyl-tRNA synthetase, class Ic  62.96 
 
 
397 aa  149  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3077  response regulator receiver domain-containing protein  62.96 
 
 
377 aa  149  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3855  haem catalase/peroxidase  62.04 
 
 
377 aa  148  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  62.04 
 
 
377 aa  146  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.651715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0532  putative transposase  56.36 
 
 
349 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0538  putative transposase  55.45 
 
 
349 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1385  putative transposase or inactivated derivative  55.45 
 
 
349 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2591  ISGsu5, transposase  58.33 
 
 
260 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0961  ISGsu4, transposase  57.41 
 
 
348 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2599  ISGsu4, transposase  57.41 
 
 
348 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0277  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.28 
 
 
336 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.34 
 
 
339 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000103198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.34 
 
 
339 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.100953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.34 
 
 
339 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.34 
 
 
339 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0279  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.44 
 
 
360 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.456081  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0859  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.44 
 
 
360 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.44 
 
 
360 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0576  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  75 
 
 
263 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  32.67 
 
 
348 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.24 
 
 
328 aa  51.6  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1224  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.24 
 
 
328 aa  51.6  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744849  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0286  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.92 
 
 
441 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150235  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.99 
 
 
442 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.27 
 
 
328 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.27 
 
 
328 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.62 
 
 
540 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.62 
 
 
540 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.62 
 
 
542 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.62 
 
 
540 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1120  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.27 
 
 
328 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0932183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.27 
 
 
288 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  35.05 
 
 
408 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  35.05 
 
 
408 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  28.85 
 
 
414 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  35.05 
 
 
408 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  35.05 
 
 
408 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  35.05 
 
 
408 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  35.05 
 
 
408 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  35.05 
 
 
408 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  35.05 
 
 
408 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1339  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.27 
 
 
328 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1384  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.27 
 
 
328 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149924  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1260  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.27 
 
 
328 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5544  transposase IS116/IS110/IS902  34.02 
 
 
440 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.362719 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0408  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.29 
 
 
326 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000108361  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.81 
 
 
345 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  30.1 
 
 
385 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  30.84 
 
 
418 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0527  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.35 
 
 
420 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.35 
 
 
420 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1045  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.35 
 
 
420 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.35 
 
 
420 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.35 
 
 
420 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1259  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.35 
 
 
420 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1515  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.35 
 
 
420 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1558  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.35 
 
 
420 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000508366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1950  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.35 
 
 
420 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0326  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.02 
 
 
408 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1225  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.02 
 
 
408 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.02 
 
 
408 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.235324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.02 
 
 
408 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402524  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.02 
 
 
408 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000616647 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3370  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.02 
 
 
408 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3374  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.02 
 
 
408 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.495996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3377  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.02 
 
 
408 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3378  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.02 
 
 
408 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.195678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3403  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.02 
 
 
408 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0158163  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3441  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.02 
 
 
408 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4041  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.02 
 
 
408 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.02 
 
 
408 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1983  transposase IS116/IS110/IS902  29.91 
 
 
394 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2868  transposase IS116/IS110/IS902  29.91 
 
 
418 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.666774  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.76 
 
 
407 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.76 
 
 
407 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.76 
 
 
407 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.76 
 
 
407 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.76 
 
 
407 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.76 
 
 
407 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>