More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1983 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1983  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
394 aa  822    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2024  transposase IS116/IS110/IS902  79.95 
 
 
396 aa  696    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000259984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  97.97 
 
 
418 aa  810    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2868  transposase IS116/IS110/IS902  97.72 
 
 
418 aa  807    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.666774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  48.32 
 
 
411 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  48.32 
 
 
411 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.06 
 
 
411 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  48.06 
 
 
412 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.29 
 
 
411 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1995  IS110 family transposase  45.14 
 
 
337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00496148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2046  IS110 family transposase OrfA  43.7 
 
 
257 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.599145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2202  IS110 family transposase orfa  43.7 
 
 
257 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2047  IS110 family transposase OrfB  57.14 
 
 
154 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2203  IS110 family transposase orfb  57.14 
 
 
154 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.92 
 
 
402 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0450  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.2 
 
 
354 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0076  transposase  25.14 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0574948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0577  putative transposase  25.14 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0868  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.14 
 
 
408 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0776051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0845  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.14 
 
 
408 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.14 
 
 
408 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1574  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.14 
 
 
408 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2497  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.14 
 
 
408 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164831  normal  0.0212022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.14 
 
 
408 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0001  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.2 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2193  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.14 
 
 
408 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.02 
 
 
403 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1544  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.41 
 
 
424 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00314291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.22 
 
 
427 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.22 
 
 
427 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2146  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.22 
 
 
427 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  24.5 
 
 
406 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  24.5 
 
 
406 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.47 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2586  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  21.96 
 
 
427 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1925  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  21.96 
 
 
427 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1884  transposase IS116/IS110/IS902  23.85 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2484  transposase IS116/IS110/IS902  23.85 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1550  transposase IS116/IS110/IS902  23.85 
 
 
429 aa  87  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2770  transposase IS116/IS110/IS902  23.85 
 
 
429 aa  87  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.74 
 
 
399 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.57 
 
 
427 aa  86.3  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0963  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.57 
 
 
427 aa  86.3  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1635  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.94 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1353  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.94 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  23.18 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.75 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1259  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.37 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1045  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.37 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0527  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.37 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1558  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.37 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000508366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1515  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.37 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.37 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.37 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.37 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1950  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.37 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0724  transposase  21.81 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0689  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.81 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1750  transposase  21.81 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.905316  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1293  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.22 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2674  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.22 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2701  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.22 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0754  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.22 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.353125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1019  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.22 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.197197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1132  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.22 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0650  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.22 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1810  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.22 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.22 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.903868  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0354  transposase IS116/IS110/IS902  24.09 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2516  transposase IS116/IS110/IS902  24.09 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2654  transposase IS116/IS110/IS902  24.09 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3689  transposase IS116/IS110/IS902  24.09 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.767433  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4714  transposase IS116/IS110/IS902  24.09 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4744  transposase IS116/IS110/IS902  24.09 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6212  transposase IS116/IS110/IS902  24.09 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1867  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.09 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.09 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2638  transposase IS111A/IS1328/IS1533  20.65 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1190  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.17 
 
 
401 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.0159286 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.17 
 
 
401 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4393  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  24.1 
 
 
421 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2078  transposase IS111A/IS1328/IS1533  24.85 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218145  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3130  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.33 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2606  transposase IS111A/IS1328/IS1533  24.85 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1112  transposase IS111A/IS1328/IS1533  24.85 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2090  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.54 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104804  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  22.42 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0814  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.27 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00371841  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.7 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  22.42 
 
 
408 aa  76.3  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1545  ISBma3, transposase  23.76 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1754  ISBma3, transposase  23.76 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1755  ISBma3, transposase  23.76 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2836  ISBma3, transposase  23.76 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3194  ISBma3, transposase  23.76 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0488  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.27 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000137882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0716  transposase IS116/IS110/IS902  23.76 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.76 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3315  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.27 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.579778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.7 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.862499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>