More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02808 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02817  hypothetical protein  99.18 
 
 		 209 aa  253  9e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06439  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  251  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02808  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  251  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05058  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  251  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00546  transposase  98.36 
 
 		 209 aa  250  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06783  hypothetical protein  98.36 
 
 		 209 aa  250  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08192  transposase  98.36 
 
 		 347 aa  248  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01926  hypothetical protein  98.36 
 
 		 347 aa  249  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02006  hypothetical protein  98.36 
 
 		 347 aa  249  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05219  hypothetical protein  98.36 
 
 		 347 aa  249  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06775  hypothetical protein  97.54 
 
 		 206 aa  248  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01473  hypothetical protein  98.18 
 
 		 110 aa  224  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.17 
 
 		 347 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.17 
 
 		 347 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.17 
 
 		 347 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4722  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  83.33 
 
 		 347 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  83.33 
 
 		 347 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00618  ISGsu4, transposase  79.17 
 
 		 329 aa  203  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01463  hypothetical protein  97.83 
 
 		 93 aa  184  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1833  Heme exporter protein CcmA  64.17 
 
 		 377 aa  169  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3462  ISGsu4, transposase  64.17 
 
 		 377 aa  169  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0104746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2346  arginyl-tRNA synthetase, class Ic  64.17 
 
 		 397 aa  168  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3077  response regulator receiver domain-containing protein  64.17 
 
 		 377 aa  168  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3855  haem catalase/peroxidase  63.33 
 
 		 377 aa  166  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  63.33 
 
 		 377 aa  165  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.651715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0532  putative transposase  56.56 
 
 		 349 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0538  putative transposase  55.74 
 
 		 349 aa  148  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1385  putative transposase or inactivated derivative  55.74 
 
 		 349 aa  148  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2591  ISGsu5, transposase  58.47 
 
 		 260 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0961  ISGsu4, transposase  55.93 
 
 		 348 aa  124  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2599  ISGsu4, transposase  55.93 
 
 		 348 aa  124  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0277  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.46 
 
 		 336 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.61 
 
 		 339 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.61 
 
 		 339 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.61 
 
 		 339 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000103198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.61 
 
 		 339 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.100953  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0279  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.12 
 
 		 360 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.456081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0859  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.12 
 
 		 360 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.12 
 
 		 360 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0576  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  79.55 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  33.04 
 
 		 348 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.09 
 
 		 345 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.75 
 
 		 540 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.75 
 
 		 540 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.75 
 
 		 540 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.75 
 
 		 542 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  29.66 
 
 		 414 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.85 
 
 		 407 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.85 
 
 		 407 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.85 
 
 		 407 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.85 
 
 		 407 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.85 
 
 		 407 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.85 
 
 		 407 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  32.48 
 
 		 385 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.68 
 
 		 402 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  35.78 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  35.78 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  35.78 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  35.78 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  35.78 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  35.78 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  35.78 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  35.78 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2757  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.9 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000451562  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.9 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.175769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2778  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.9 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.335835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14300  transposase IS116/IS110/IS902  35.04 
 
 		 392 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  31.4 
 
 		 418 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  28.81 
 
 		 414 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.45 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  32.23 
 
 		 406 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  32.23 
 
 		 406 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0645  transposase  34.48 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  31.62 
 
 		 385 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2868  transposase IS116/IS110/IS902  30.58 
 
 		 418 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.666774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0286  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.79 
 
 		 441 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150235  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.63 
 
 		 442 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1983  transposase IS116/IS110/IS902  30.58 
 
 		 394 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0350  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.03 
 
 		 316 aa  53.5  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.144178  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.03 
 
 		 316 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6341  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.65 
 
 		 408 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6342  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.65 
 
 		 408 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.03 
 
 		 316 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.334176  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0736  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.9 
 
 		 317 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000627011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1960  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.61 
 
 		 411 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.261169  normal  0.0163724 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5544  transposase IS116/IS110/IS902  34.58 
 
 		 440 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.362719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0725  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.65 
 
 		 411 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.36 
 
 		 403 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.97 
 
 		 342 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.97 
 
 		 342 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.97 
 
 		 342 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.9 
 
 		 317 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0218502  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.23 
 
 		 343 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.23 
 
 		 343 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3882  transposase, IS1111 family  31.03 
 
 		 339 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.75 
 
 		 328 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.59 
 
 		 328 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.75 
 
 		 328 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2240  transposase, IS1111 family  31.03 
 
 		 339 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000963569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3130  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.79 
 
 		 378 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>