More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02817 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02817  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  438  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06783  hypothetical protein  99.04 
 
 
209 aa  434  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00546  transposase  98.09 
 
 
209 aa  431  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08192  transposase  99.02 
 
 
347 aa  418  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02006  hypothetical protein  99.02 
 
 
347 aa  418  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05219  hypothetical protein  99.02 
 
 
347 aa  418  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01926  hypothetical protein  99.02 
 
 
347 aa  418  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06775  hypothetical protein  97.54 
 
 
206 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  68.78 
 
 
347 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4722  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  68.78 
 
 
347 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  68.78 
 
 
347 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  68.78 
 
 
347 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  68.29 
 
 
347 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00618  ISGsu4, transposase  62.87 
 
 
329 aa  264  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05058  hypothetical protein  99.18 
 
 
122 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02808  hypothetical protein  99.18 
 
 
122 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06439  hypothetical protein  99.18 
 
 
122 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01473  hypothetical protein  98.18 
 
 
110 aa  226  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1833  Heme exporter protein CcmA  47.26 
 
 
377 aa  204  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3462  ISGsu4, transposase  47.26 
 
 
377 aa  204  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0104746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2346  arginyl-tRNA synthetase, class Ic  47.26 
 
 
397 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3077  response regulator receiver domain-containing protein  47.26 
 
 
377 aa  203  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0532  putative transposase  47.78 
 
 
349 aa  202  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3855  haem catalase/peroxidase  46.77 
 
 
377 aa  202  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  46.77 
 
 
377 aa  201  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.651715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0538  putative transposase  44.33 
 
 
349 aa  191  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1385  putative transposase or inactivated derivative  44.33 
 
 
349 aa  190  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01463  hypothetical protein  96.74 
 
 
93 aa  184  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0961  ISGsu4, transposase  45.54 
 
 
348 aa  171  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2599  ISGsu4, transposase  45.54 
 
 
348 aa  171  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15041  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0576  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.26 
 
 
263 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525286  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01474  hypothetical protein  96.88 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2591  ISGsu5, transposase  57.5 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0277  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.03 
 
 
336 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01464  hypothetical protein  92.73 
 
 
59 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06438  hypothetical protein  92.73 
 
 
59 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05059  hypothetical protein  92.73 
 
 
59 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02807  hypothetical protein  92.73 
 
 
59 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00628  ISGsu4, transposase  46.96 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000155742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.35 
 
 
339 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.35 
 
 
339 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.100953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.35 
 
 
339 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000103198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.35 
 
 
339 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0279  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.79 
 
 
360 aa  98.2  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.456081  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0859  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.79 
 
 
360 aa  98.2  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.79 
 
 
360 aa  98.2  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  27.17 
 
 
414 aa  72.4  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.77 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.1 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1224  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.1 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744849  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.77 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.77 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.77 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.77 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.77 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 
540 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 
540 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 
540 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 
542 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  35.94 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  35.94 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  35.94 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  35.94 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  35.94 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  35.94 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  35.94 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  35.94 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1120  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0932183  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.93 
 
 
345 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.58 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.175769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2778  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.58 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.335835  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  28.22 
 
 
385 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1384  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149924  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2757  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.58 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000451562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  30.07 
 
 
348 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1260  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 
328 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1339  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 
328 aa  65.5  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  26.09 
 
 
414 aa  65.1  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0408  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.72 
 
 
326 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000108361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.34 
 
 
402 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  28.22 
 
 
385 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0645  transposase  33.86 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  28.66 
 
 
406 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  28.66 
 
 
406 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0736  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.58 
 
 
317 aa  62.8  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000627011  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.58 
 
 
317 aa  62.8  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0218502  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.32 
 
 
316 aa  62.4  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.334176  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0350  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.32 
 
 
316 aa  62.4  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.144178  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.32 
 
 
316 aa  62.4  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.74 
 
 
406 aa  62  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2345  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.32 
 
 
316 aa  61.6  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  27.78 
 
 
350 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1960  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.86 
 
 
411 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.261169  normal  0.0163724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.78 
 
 
350 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14300  transposase IS116/IS110/IS902  34.43 
 
 
392 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.79 
 
 
406 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2322  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.79 
 
 
406 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>