233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00628 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00628  ISGsu4, transposase  100 
 
 		 238 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000155742  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00618  ISGsu4, transposase  100 
 
 		 329 aa  489  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01926  hypothetical protein  58.55 
 
 		 347 aa  296  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02006  hypothetical protein  58.55 
 
 		 347 aa  296  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05219  hypothetical protein  58.55 
 
 		 347 aa  296  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08192  transposase  58.12 
 
 		 347 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.79 
 
 		 347 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4722  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.79 
 
 		 347 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.79 
 
 		 347 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.79 
 
 		 347 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.94 
 
 		 347 aa  255  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0961  ISGsu4, transposase  51.72 
 
 		 348 aa  246  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2599  ISGsu4, transposase  51.72 
 
 		 348 aa  246  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0532  putative transposase  51.07 
 
 		 349 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0538  putative transposase  48.5 
 
 		 349 aa  236  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01474  hypothetical protein  58.29 
 
 		 207 aa  235  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1385  putative transposase or inactivated derivative  47.64 
 
 		 349 aa  231  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1833  Heme exporter protein CcmA  46.58 
 
 		 377 aa  230  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  46.78 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.651715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3462  ISGsu4, transposase  46.58 
 
 		 377 aa  230  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0104746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2346  arginyl-tRNA synthetase, class Ic  46.35 
 
 		 397 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3077  response regulator receiver domain-containing protein  46.35 
 
 		 377 aa  229  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3855  haem catalase/peroxidase  46.35 
 
 		 377 aa  227  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02815  hypothetical protein  67.97 
 
 		 147 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06781  hypothetical protein  67.97 
 
 		 147 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2591  ISGsu5, transposase  63.25 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02021  hypothetical protein  75.29 
 
 		 85 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0576  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.43 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525286  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06783  hypothetical protein  47.83 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02817  hypothetical protein  46.96 
 
 		 209 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00546  transposase  46.96 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06775  hypothetical protein  46.36 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0279  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.76 
 
 		 360 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.456081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0859  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.76 
 
 		 360 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.76 
 
 		 360 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2393  ISGsu5, transposase, truncation  52.94 
 
 		 198 aa  92.8  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.04 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.98 
 
 		 342 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.04 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000103198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.04 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.04 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.100953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.98 
 
 		 342 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.98 
 
 		 342 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  28.09 
 
 		 385 aa  82  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  28.69 
 
 		 385 aa  82  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0277  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.29 
 
 		 336 aa  78.6  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0587  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.64 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0703  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.64 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.64 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2874  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.64 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3008  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.64 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.64 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.143996 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.1 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.41 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.41 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.35 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.27 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.27 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.53 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  26.87 
 
 		 384 aa  58.5  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  23.91 
 
 		 350 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1068  transposase IS110 family protein  22.71 
 
 		 362 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1742  transposase IS110 family protein  22.71 
 
 		 362 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2805  transposase IS110 family protein  22.71 
 
 		 362 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2419  transposase IS110 family protein  22.71 
 
 		 362 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1027  transposase IS110 family protein  22.71 
 
 		 362 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1602  transposase IS110 family protein  22.71 
 
 		 362 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  24.67 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.63 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  26.87 
 
 		 414 aa  55.1  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02604  hypothetical protein  54.55 
 
 		 94 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  25.13 
 
 		 411 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  25.13 
 
 		 411 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  25.13 
 
 		 411 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  25.13 
 
 		 411 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  25.13 
 
 		 411 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  25.13 
 
 		 411 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1029  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.85 
 
 		 134 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1095  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.63 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5311  transposase  24.24 
 
 		 344 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414868  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.89 
 
 		 369 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.89 
 
 		 369 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5379  putative transposase for insertion sequence element  28.71 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.63 
 
 		 367 aa  52.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.63 
 
 		 343 aa  52.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  28.12 
 
 		 332 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2322  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.93 
 
 		 406 aa  52.4  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.93 
 
 		 406 aa  52.4  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2321  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.93 
 
 		 406 aa  52.4  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.69 
 
 		 340 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.69 
 
 		 340 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.85 
 
 		 348 aa  52  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.4 
 
 		 378 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.85 
 
 		 348 aa  52  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4496  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 		 345 aa  52  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1223  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  24.81 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  26.21 
 
 		 384 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  24.36 
 
 		 343 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  24.36 
 
 		 343 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06439  hypothetical protein  77.78 
 
 		 122 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>