More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6214 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  82.15 
 
 		 411 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  82.15 
 
 		 411 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  82.15 
 
 		 411 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  82.15 
 
 		 411 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  82.15 
 
 		 411 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  82.15 
 
 		 411 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 381 aa  780    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0442  transposase  76.41 
 
 		 380 aa  554  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.145361  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  73.16 
 
 		 411 aa  547  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  55.14 
 
 		 412 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.97 
 
 		 378 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1437  hypothetical protein  76.67 
 
 		 168 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1436  hypothetical protein  80.17 
 
 		 237 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8273  transposase  51.41 
 
 		 186 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  35.16 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  33 
 
 		 385 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.57 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.57 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.57 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1055  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.12 
 
 		 307 aa  116  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.124364  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7300  putative transposase  58.14 
 
 		 125 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  30.42 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  29.43 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  25.95 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  29.64 
 
 		 348 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  29.64 
 
 		 346 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.64 
 
 		 374 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.93 
 
 		 332 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.93 
 
 		 332 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.93 
 
 		 332 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.93 
 
 		 332 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  34.12 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  34.12 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2031  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.68 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  28.62 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.67 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.67 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  25.14 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  25.14 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.44 
 
 		 373 aa  86.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2599  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.61 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3187  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3529  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.61 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458804  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.22 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  27.73 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.66 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  32.52 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00618  ISGsu4, transposase  25.35 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  28.63 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  28.63 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  28.63 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  28.63 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  28.63 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  28.63 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  28.63 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  28.63 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  30.5 
 
 		 285 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.1 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  29.57 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.1 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  28.63 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.2 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.2 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  28.63 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  27.34 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.06 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.06 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.06 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.32 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.83 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  32.56 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.18 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0984  hypothetical protein  25.82 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.6 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  25.99 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  28.22 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.62 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  33.17 
 
 		 296 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4384  transposase IS116/IS110/IS902  29.83 
 
 		 339 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0464  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.28 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.14 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.48 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.62 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.46 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.46 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.15 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.02 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.02 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  25.1 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.02 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.02 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.02 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.74 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.26 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402524  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3370  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.26 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3374  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.26 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.495996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3377  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.26 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3378  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.26 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.195678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3403  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.26 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0158163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3441  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.26 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4041  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.26 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>