More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5358 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
373 aa  756    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.3 
 
 
372 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.53 
 
 
370 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.53 
 
 
370 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.53 
 
 
370 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.88 
 
 
369 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.04 
 
 
369 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.04 
 
 
369 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.04 
 
 
369 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.04 
 
 
369 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  51.24 
 
 
403 aa  363  3e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  51.24 
 
 
371 aa  362  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.22 
 
 
369 aa  361  9e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.22 
 
 
369 aa  361  9e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  48.39 
 
 
384 aa  351  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  49.45 
 
 
384 aa  350  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  50 
 
 
332 aa  338  7e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.53 
 
 
376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.53 
 
 
376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  45.86 
 
 
391 aa  322  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  45.86 
 
 
391 aa  322  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  45.86 
 
 
391 aa  322  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  45.86 
 
 
391 aa  322  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  45.86 
 
 
391 aa  322  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  45.86 
 
 
391 aa  322  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  45.58 
 
 
391 aa  322  7e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.34 
 
 
366 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  45.58 
 
 
391 aa  321  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  45.58 
 
 
391 aa  320  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  45.58 
 
 
391 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  45.58 
 
 
391 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  45.58 
 
 
391 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.33 
 
 
376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.77 
 
 
359 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  52.24 
 
 
265 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  50.56 
 
 
285 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  47.16 
 
 
296 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.45 
 
 
361 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  36.49 
 
 
363 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.49 
 
 
363 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  57.69 
 
 
159 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  46.97 
 
 
229 aa  186  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  36.87 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  36.87 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.06 
 
 
374 aa  155  9e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3840  hypothetical protein  56.69 
 
 
157 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0569729 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4617  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  55.26 
 
 
243 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219004  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  52.21 
 
 
206 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  29.65 
 
 
358 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4849  transposase IS111A/IS1328/IS1533  48.31 
 
 
134 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0631006 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03430  transposase  34.09 
 
 
261 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  29.43 
 
 
411 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  29.43 
 
 
411 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  29.43 
 
 
411 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  29.43 
 
 
411 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  29.43 
 
 
411 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  29.43 
 
 
411 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.9 
 
 
411 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.84 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4384  transposase IS116/IS110/IS902  32.38 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  30.28 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3060  transposase IS116/IS110/IS902  27.25 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137931  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.68 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  28.57 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1550  transposase IS116/IS110/IS902  24.79 
 
 
429 aa  77  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2770  transposase IS116/IS110/IS902  24.79 
 
 
429 aa  77  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1954  transposase IS116/IS110/IS902  28.53 
 
 
385 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2773  transposase IS116/IS110/IS902  28.22 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1884  transposase IS116/IS110/IS902  24.79 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2484  transposase IS116/IS110/IS902  24.79 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.77 
 
 
499 aa  76.3  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.29 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.44 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.66 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  29.38 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  29.38 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09760  Transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.39 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  29.1 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  29.1 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.76 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.76 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  30.37 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  25.76 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  25.76 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.76 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.55 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0894966  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3945  IS110 family transposase  25.55 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4548  IS110 family transposase  25.55 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4139  transposase IS116/IS110/IS902  26.09 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2090  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.11 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.54 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0372  ISPsy7, transposase  27.33 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2167  ISPsy7, transposase  27.33 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3130  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.11 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3146  ISPsy7, transposase  27.33 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0791519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3325  ISPsy7, transposase  27.33 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0495526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3746  ISPsy7, transposase  27.33 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3800  ISPsy7, transposase  27.33 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5571  ISPsy7, transposase  27.33 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  27.21 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>