More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1121 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
363 aa  732    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
363 aa  732    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  68.13 
 
 
361 aa  498  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  41.37 
 
 
368 aa  235  7e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  41.37 
 
 
368 aa  235  7e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  37.64 
 
 
391 aa  219  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  37.64 
 
 
391 aa  219  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  37.64 
 
 
391 aa  219  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  37.64 
 
 
391 aa  219  7e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  37.64 
 
 
391 aa  219  7e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  37.64 
 
 
391 aa  219  7e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  37.64 
 
 
391 aa  219  7e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  37.64 
 
 
391 aa  219  7e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  37.64 
 
 
391 aa  219  7e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  37.64 
 
 
391 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  37.36 
 
 
391 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  37.36 
 
 
391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.82 
 
 
376 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.82 
 
 
376 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.38 
 
 
372 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.34 
 
 
376 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  37.15 
 
 
371 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  37.15 
 
 
403 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.71 
 
 
369 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.71 
 
 
369 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.61 
 
 
374 aa  202  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.03 
 
 
370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.03 
 
 
370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.03 
 
 
370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.29 
 
 
369 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.08 
 
 
366 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.01 
 
 
369 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.01 
 
 
369 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.01 
 
 
369 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.01 
 
 
369 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.89 
 
 
359 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  38.51 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.49 
 
 
373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  31.11 
 
 
384 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  30.87 
 
 
384 aa  169  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03430  transposase  40.24 
 
 
261 aa  159  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  36.75 
 
 
296 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  34.22 
 
 
265 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  29.37 
 
 
285 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  48.37 
 
 
159 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  30.27 
 
 
358 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  36.07 
 
 
229 aa  106  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  31.36 
 
 
348 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4384  transposase IS116/IS110/IS902  29.37 
 
 
339 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.78 
 
 
342 aa  87  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  28.28 
 
 
382 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.78 
 
 
342 aa  87  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  27.36 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  27 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.15 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  29.69 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  29.69 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.78 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.49 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.16 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.38 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.38 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.38 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.38 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4642  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.03 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.882664  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.78 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  27.71 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  28.34 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  27.47 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  27.78 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  27.78 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  28.34 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  28.34 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  28.34 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  28.34 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  28.34 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4849  transposase IS111A/IS1328/IS1533  39.64 
 
 
134 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0631006 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  28.17 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.79 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.79 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  25.7 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  27.09 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0384  putative transposase  27.09 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  25.7 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3079  transposase IS116/IS110/IS902  28.46 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3085  transposase IS116/IS110/IS902  28.46 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.52 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.48 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1575  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.48 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0511159  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.48 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.48 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3274  ISPsy7, transposase  24.68 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0336107  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.83 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  26.5 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2465  ISPsy7, transposase  24.68 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3800  ISPsy7, transposase  24.68 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5571  ISPsy7, transposase  24.68 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2273  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.93 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.508057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.93 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0392691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0928  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.93 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>