More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1233 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  95.39 
 
 
369 aa  726    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.85 
 
 
369 aa  722    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.85 
 
 
369 aa  722    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  94.85 
 
 
369 aa  722    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
369 aa  753    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  82.32 
 
 
332 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.53 
 
 
372 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.88 
 
 
373 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.95 
 
 
370 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.95 
 
 
370 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.95 
 
 
370 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.69 
 
 
376 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  51.82 
 
 
371 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  51.82 
 
 
403 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.69 
 
 
376 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  50 
 
 
391 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  50 
 
 
391 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  50 
 
 
391 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  50 
 
 
391 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  50 
 
 
391 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  50 
 
 
391 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  50 
 
 
391 aa  363  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  49.72 
 
 
391 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  49.72 
 
 
391 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  49.72 
 
 
391 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  49.72 
 
 
391 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  49.72 
 
 
391 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.66 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.28 
 
 
369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.28 
 
 
369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  49.86 
 
 
384 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  63.4 
 
 
265 aa  348  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  48.52 
 
 
384 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.75 
 
 
376 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.92 
 
 
359 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  49.82 
 
 
296 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  50.74 
 
 
285 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 
361 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  36.29 
 
 
363 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.29 
 
 
363 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  36.39 
 
 
368 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  36.39 
 
 
368 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  46.19 
 
 
229 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.42 
 
 
374 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  55.19 
 
 
159 aa  166  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3840  hypothetical protein  60.61 
 
 
157 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0569729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  32.05 
 
 
358 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4617  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  51.79 
 
 
243 aa  119  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219004  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4849  transposase IS111A/IS1328/IS1533  49.12 
 
 
134 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0631006 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03430  transposase  33.59 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  46.02 
 
 
206 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  27.15 
 
 
411 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  27.15 
 
 
411 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  27.15 
 
 
411 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  27.15 
 
 
411 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  27.15 
 
 
411 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  27.15 
 
 
411 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.08 
 
 
378 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  27.2 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  27.2 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.69 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.69 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.99 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.79 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.28 
 
 
411 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.79 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0984  hypothetical protein  25.21 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1550  transposase IS116/IS110/IS902  23.8 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2770  transposase IS116/IS110/IS902  23.8 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1884  transposase IS116/IS110/IS902  23.8 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2484  transposase IS116/IS110/IS902  23.8 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1270  hypothetical protein  26.69 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.251236 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  32.81 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  32.81 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  29.89 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3552  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.41 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0928  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.41 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.41 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0392691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2273  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.41 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.508057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.41 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.93 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3079  transposase IS116/IS110/IS902  25.25 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3085  transposase IS116/IS110/IS902  25.25 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0504  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.37 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0754  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.37 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0914  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.37 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.694774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3024  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.37 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.923031 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.44 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.44 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.34 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4139  transposase IS116/IS110/IS902  28.17 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.53 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.53 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  25.25 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  31.8 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.65 
 
 
383 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  25.74 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>