More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1884 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1550  transposase IS116/IS110/IS902  99.77 
 
 		 429 aa  879    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1884  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 429 aa  881    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2484  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 429 aa  881    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2770  transposase IS116/IS110/IS902  99.77 
 
 		 429 aa  879    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.51 
 
 		 404 aa  462  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0814  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.1 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00371841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0488  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.1 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000137882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3315  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.1 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.579778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  31.62 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  31.62 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.83 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.84 
 
 		 393 aa  206  9e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  36.97 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.05 
 
 		 406 aa  167  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1925  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.93 
 
 		 427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2586  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.93 
 
 		 427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.37 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.37 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2146  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.37 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.65 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.65 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1259  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.65 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1950  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.65 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1558  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.65 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000508366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1515  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.65 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.65 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0527  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.65 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1045  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.65 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.76 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2015  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.76 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.792556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2829  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.76 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1826  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.76 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.508781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0349  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.76 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.248005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0850  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.76 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.884754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.76 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1351  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.76 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000796647  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0076  transposase  26.79 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0574948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0577  putative transposase  26.79 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1800  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.05 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  28.25 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0729  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.05 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.876532 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1544  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.21 
 
 		 424 aa  106  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00314291  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  26.74 
 
 		 411 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  25.73 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  26.73 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  27.17 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.8 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3558  hypothetical protein  25.63 
 
 		 403 aa  99.8  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3521  hypothetical protein  25.63 
 
 		 403 aa  99.8  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880505 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1828  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.63 
 
 		 403 aa  99.8  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1360  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.49 
 
 		 407 aa  99.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000458925  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3962  hypothetical protein  25.63 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.462715  normal  0.0823882 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3473  hypothetical protein  25.63 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0880625 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0724  transposase  24.33 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1750  transposase  24.33 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.905316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0040  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.49 
 
 		 407 aa  99.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.268434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0729  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.49 
 
 		 407 aa  99.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4628  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.89 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0251  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.49 
 
 		 407 aa  99.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1194  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.49 
 
 		 407 aa  99.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000290611  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0558  ISSep1-like transposase  27.62 
 
 		 337 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0544  ISSep1-like transposase  27.62 
 
 		 337 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.89 
 
 		 403 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0160  ISSep1-like transposase  27.83 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0260  ISSep1-like transposase  27.83 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0380  ISSep1-like transposase  27.83 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0565  ISSep1-like transposase  28.7 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0577  ISSep1-like transposase  27.83 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.388646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0991  ISSep1-like transposase  27.83 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1730  ISSep1-like transposase  27.83 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000971497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1911  ISSep1-like transposase  28.7 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.07 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5641  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.7 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2701  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.27 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1293  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.27 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0754  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.27 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.353125  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.59 
 
 		 321 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1820  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.59 
 
 		 321 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161882  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1633  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.59 
 
 		 321 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0380198  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1462  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.59 
 
 		 321 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2674  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.27 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1132  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.27 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0650  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.27 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.59 
 
 		 321 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3243  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.59 
 
 		 321 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1019  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.27 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.197197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1810  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.27 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.27 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.903868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1551  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.34 
 
 		 426 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1542  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.34 
 
 		 426 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000639136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2083  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.34 
 
 		 426 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470228  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2554  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.59 
 
 		 321 aa  94  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.964231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0697  ISSep1-like transposase  27.54 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0911  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.85 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1023  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.85 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000543141  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.96 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0728  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.85 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000210486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1369  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.45 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.45 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000186467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2024  transposase IS116/IS110/IS902  24.66 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000259984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>