47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3415 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.98 
 
 		 370 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.98 
 
 		 370 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.98 
 
 		 370 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  53.98 
 
 		 371 aa  131  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  53.98 
 
 		 403 aa  131  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.98 
 
 		 372 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.21 
 
 		 373 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.33 
 
 		 369 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.33 
 
 		 369 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  46.9 
 
 		 332 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  47.79 
 
 		 265 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.02 
 
 		 369 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.02 
 
 		 369 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.02 
 
 		 369 aa  104  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.02 
 
 		 369 aa  104  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.02 
 
 		 369 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  38.33 
 
 		 285 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  38.33 
 
 		 384 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  42.34 
 
 		 391 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  42.34 
 
 		 391 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  42.34 
 
 		 391 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  42.34 
 
 		 391 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  42.34 
 
 		 391 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  42.34 
 
 		 391 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  42.34 
 
 		 391 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  42.34 
 
 		 391 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  42.34 
 
 		 391 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  42.34 
 
 		 391 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  42.34 
 
 		 391 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  42.34 
 
 		 391 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  36.36 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.02 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.17 
 
 		 366 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.36 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.36 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.54 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  84.62 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  41.67 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  33.06 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.71 
 
 		 361 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.61 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  33.61 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03430  transposase  35.44 
 
 		 261 aa  51.6  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  35.44 
 
 		 368 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  35.44 
 
 		 368 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.27 
 
 		 374 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>