More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2272 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 371 aa  752    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  99.73 
 
 		 403 aa  750    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  79.84 
 
 		 369 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  79.84 
 
 		 369 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.88 
 
 		 370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.88 
 
 		 370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.88 
 
 		 370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.61 
 
 		 372 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.82 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.1 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.24 
 
 		 373 aa  362  4e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  44.54 
 
 		 391 aa  318  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  44.54 
 
 		 391 aa  318  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  44.54 
 
 		 391 aa  318  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  44.54 
 
 		 391 aa  318  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  44.54 
 
 		 391 aa  318  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  44.54 
 
 		 391 aa  318  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  44.81 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  44.26 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  44.54 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  44.26 
 
 		 391 aa  315  7e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  44.26 
 
 		 391 aa  315  7e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  44.26 
 
 		 391 aa  315  7e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  50.16 
 
 		 332 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.54 
 
 		 376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.54 
 
 		 376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.6 
 
 		 376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  42.43 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.81 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  41.39 
 
 		 384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  47.49 
 
 		 265 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  44.37 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  42.8 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.97 
 
 		 361 aa  212  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  37.15 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.15 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  36.07 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  36.07 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  53.9 
 
 		 159 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  39.5 
 
 		 229 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3840  hypothetical protein  56.82 
 
 		 157 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0569729 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.54 
 
 		 374 aa  149  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  53.98 
 
 		 206 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  32.22 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4617  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  51.79 
 
 		 243 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219004  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03430  transposase  36 
 
 		 261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4849  transposase IS111A/IS1328/IS1533  46.22 
 
 		 134 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0631006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.27 
 
 		 411 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  28.8 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.62 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.16 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.41 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.87 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.87 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  25.4 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  25.4 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  25.4 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  25.4 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  25.4 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  25.4 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.76 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  26.56 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.62 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.62 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.62 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  30.07 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.15 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.95 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.15 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  29.32 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  29.32 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  25.17 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.58 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4384  transposase IS116/IS110/IS902  28.7 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.91 
 
 		 393 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.1 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0834  transposase IS116/IS110/IS902  25.48 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.1 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1575  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.1 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0511159  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.1 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3060  transposase IS116/IS110/IS902  25.52 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137931  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.69 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.74 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.74 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.42 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.07 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  26.02 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  26.02 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01349  hypothetical protein  23.39 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0169  transposase InsD2 for insertion sequence IS4321L  24.59 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2770  transposase IS116/IS110/IS902  22.27 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2484  transposase IS116/IS110/IS902  22.27 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  24.19 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.52 
 
 		 539 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191643  normal  0.811146 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1550  transposase IS116/IS110/IS902  22.27 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1884  transposase IS116/IS110/IS902  22.27 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>