More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0499 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
370 aa  743    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
370 aa  743    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
370 aa  743    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.23 
 
 
372 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  57.88 
 
 
371 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  58.73 
 
 
403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.08 
 
 
369 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.08 
 
 
369 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.53 
 
 
373 aa  398  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.95 
 
 
369 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.3 
 
 
369 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.3 
 
 
369 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.57 
 
 
369 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.3 
 
 
369 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  49.18 
 
 
384 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  49.18 
 
 
391 aa  363  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  49.18 
 
 
391 aa  363  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  49.18 
 
 
391 aa  363  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  49.18 
 
 
391 aa  363  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  49.18 
 
 
391 aa  363  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  49.18 
 
 
391 aa  363  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  49.18 
 
 
391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  48.9 
 
 
391 aa  362  6e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  48.9 
 
 
391 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  47.28 
 
 
384 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  48.9 
 
 
391 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  48.9 
 
 
391 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  48.9 
 
 
391 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.45 
 
 
376 aa  358  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.45 
 
 
376 aa  358  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.73 
 
 
376 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  54.57 
 
 
332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.65 
 
 
366 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.77 
 
 
359 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  50.93 
 
 
285 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  49.82 
 
 
296 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  49.24 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.77 
 
 
361 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  36.03 
 
 
363 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.03 
 
 
363 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  45.73 
 
 
229 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  55.41 
 
 
159 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  38.29 
 
 
368 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  38.29 
 
 
368 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3840  hypothetical protein  57.25 
 
 
157 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0569729 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.22 
 
 
374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  53.98 
 
 
206 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  29.11 
 
 
358 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4617  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  54.46 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219004  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4849  transposase IS111A/IS1328/IS1533  52.99 
 
 
134 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0631006 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03430  transposase  36.5 
 
 
261 aa  99.8  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  27.33 
 
 
411 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  27.33 
 
 
411 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  27.33 
 
 
411 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  27.33 
 
 
411 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  27.33 
 
 
411 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  27.33 
 
 
411 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  28.16 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4384  transposase IS116/IS110/IS902  29.43 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.77 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  29.48 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.08 
 
 
411 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.71 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.57 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  27.59 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1544  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.55 
 
 
424 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00314291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.73 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  26.79 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  26.79 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0724  transposase  24.69 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1750  transposase  24.69 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.905316  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.91 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.3 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.3 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.3 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.32 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.32 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.03 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.03 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.03 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.03 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  23.86 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  23.86 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2350  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.61 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467502  normal  0.925611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  26.42 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4650  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.61 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.61 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4334  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.61 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.73 
 
 
338 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.37 
 
 
340 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.73 
 
 
338 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.73 
 
 
338 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.73 
 
 
338 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.73 
 
 
338 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.73 
 
 
338 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.73 
 
 
338 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.73 
 
 
338 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.37 
 
 
340 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.68 
 
 
338 aa  67  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.78 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>