More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3399 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  100 
 
 		 391 aa  809    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  99.74 
 
 		 391 aa  808    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  100 
 
 		 391 aa  809    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  100 
 
 		 391 aa  809    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  99.74 
 
 		 391 aa  807    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  99.74 
 
 		 391 aa  808    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  100 
 
 		 391 aa  809    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  99.74 
 
 		 391 aa  808    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  99.74 
 
 		 391 aa  808    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  99.49 
 
 		 391 aa  805    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  100 
 
 		 391 aa  809    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  100 
 
 		 391 aa  809    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  73.8 
 
 		 376 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  73.8 
 
 		 376 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  74.39 
 
 		 376 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  73.99 
 
 		 359 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  73.61 
 
 		 296 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.18 
 
 		 370 aa  363  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 369 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.18 
 
 		 370 aa  363  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.18 
 
 		 370 aa  363  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.8 
 
 		 372 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.3 
 
 		 369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.3 
 
 		 369 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.3 
 
 		 369 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.3 
 
 		 369 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  46.99 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  47.14 
 
 		 384 aa  347  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.78 
 
 		 366 aa  339  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.86 
 
 		 373 aa  322  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  49.07 
 
 		 332 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  43.62 
 
 		 403 aa  320  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  44.54 
 
 		 371 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.44 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.44 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  47.57 
 
 		 285 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  44.4 
 
 		 265 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.73 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  37.64 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.64 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4849  transposase IS111A/IS1328/IS1533  71.43 
 
 		 134 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0631006 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  34.97 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  34.97 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  43.63 
 
 		 229 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.03 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  51.28 
 
 		 159 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3840  hypothetical protein  53.91 
 
 		 157 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0569729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  29.36 
 
 		 358 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03430  transposase  31.89 
 
 		 261 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  29.73 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  29.73 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  29.73 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  29.73 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  29.73 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  29.73 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  31.86 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  30.79 
 
 		 412 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4617  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  40 
 
 		 243 aa  93.2  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219004  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  42.34 
 
 		 206 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.35 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.09 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.93 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  31.76 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0420  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.64 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.505661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1751  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.64 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3108  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.64 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.690807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  26.17 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  26.17 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  27.92 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.38 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  27.61 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  27.61 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2031  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.69 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2599  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.78 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3187  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.85 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  31.85 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3529  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.78 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458804  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  25.7 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  30 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.72 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  26.71 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  26.71 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.7 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  26.71 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  31.58 
 
 		 341 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  23.55 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  36.36 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  26.71 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  26.71 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  26.71 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.08 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.43 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.5 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.5 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.43 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.62 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  24.31 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.62 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4956  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.35 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>