More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3851 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 366 aa  724    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.99 
 
 		 384 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3995  transposase IS116/IS110/IS902  49.15 
 
 		 417 aa  320  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4315  transposase IS116/IS110/IS902  52.76 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3060  transposase IS116/IS110/IS902  48.2 
 
 		 383 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137931  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  51.98 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  51.98 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.58 
 
 		 539 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191643  normal  0.811146 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.46 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.7 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1954  transposase IS116/IS110/IS902  42.37 
 
 		 385 aa  245  9e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2773  transposase IS116/IS110/IS902  42.37 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3938  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.88 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  41.26 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  42.73 
 
 		 383 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  42.73 
 
 		 383 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  38.63 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.78 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.09 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.76 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.97 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  29.69 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.89 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.26 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  27.11 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  25.78 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  28.72 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.76 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.51 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.01 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  27.71 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  27.71 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  27.71 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  27.71 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  27.71 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  27.71 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  27.71 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  27.71 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  27.71 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.32 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.32 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  29.66 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  27.41 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.92 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  27.41 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.47 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.914842  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3155  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.47 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.54 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2242  transposase family protein  27.78 
 
 		 455 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860997  normal  0.210427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.15 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3079  transposase IS116/IS110/IS902  29.3 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3085  transposase IS116/IS110/IS902  29.3 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.53 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  29.03 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3394  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.36 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.03 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.87 
 
 		 344 aa  67  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.87 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.87 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  29.25 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.87 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  28.95 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.17 
 
 		 499 aa  66.2  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  28.15 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  28.15 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  28.15 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  28.15 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4956  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.71 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.38 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.26 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.12 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.12 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1055  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.52 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.124364  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4139  transposase IS116/IS110/IS902  26.98 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  24.13 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  29.87 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2266  transposase IS116/IS110/IS902  27.71 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.12 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.12 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  31.87 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  31.87 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  31.87 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.78 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5572  transposase IS116/IS110/IS902  30.22 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  30.56 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  27.36 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.67 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.64 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0894966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2657  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.73 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0488  putative transposase IS116/IS110/IS902  34.12 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.57 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  27.16 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.73 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0803488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.75 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  25.66 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  25.66 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  27.16 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  25.07 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>