More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7352 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
376 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
376 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  79.4 
 
 
376 aa  621  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  89.47 
 
 
359 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  73.8 
 
 
391 aa  598  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  73.53 
 
 
391 aa  597  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  73.8 
 
 
391 aa  598  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  73.8 
 
 
391 aa  598  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  73.8 
 
 
391 aa  598  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  73.8 
 
 
391 aa  598  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  73.8 
 
 
391 aa  598  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  73.53 
 
 
391 aa  595  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  73.53 
 
 
391 aa  595  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  73.53 
 
 
391 aa  595  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  73.53 
 
 
391 aa  595  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  73.53 
 
 
391 aa  597  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  83.73 
 
 
296 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  49.73 
 
 
384 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.69 
 
 
369 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.27 
 
 
369 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.41 
 
 
369 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.41 
 
 
369 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.41 
 
 
369 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.63 
 
 
372 aa  362  8e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  49.45 
 
 
384 aa  361  9e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.45 
 
 
370 aa  358  7e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.45 
 
 
370 aa  358  7e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.45 
 
 
370 aa  358  7e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.33 
 
 
366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  51.38 
 
 
332 aa  329  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.53 
 
 
373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.81 
 
 
369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.81 
 
 
369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  44.54 
 
 
371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  45.13 
 
 
403 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  50.19 
 
 
285 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.62 
 
 
361 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  44.79 
 
 
265 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  38.1 
 
 
363 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.1 
 
 
363 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4849  transposase IS111A/IS1328/IS1533  77.31 
 
 
134 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0631006 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  44.75 
 
 
229 aa  182  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  34.52 
 
 
368 aa  167  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  34.52 
 
 
368 aa  167  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.64 
 
 
374 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  51.97 
 
 
159 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3840  hypothetical protein  53.85 
 
 
157 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0569729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  31.51 
 
 
358 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  32.97 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.66 
 
 
378 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4617  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.2 
 
 
243 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219004  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03430  transposase  31.5 
 
 
261 aa  95.9  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  28.73 
 
 
411 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  28.73 
 
 
411 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  28.73 
 
 
411 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  28.73 
 
 
411 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  28.73 
 
 
411 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  28.73 
 
 
411 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.73 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.49 
 
 
411 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  26.82 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  26.82 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.14 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  28.4 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.39 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.99 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.27 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.27 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  36.36 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  30.23 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.89 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4384  transposase IS116/IS110/IS902  31.31 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  26.67 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  26.98 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  26.98 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.03 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.1 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.24 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.24 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1462  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.79 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3243  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.79 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.79 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.79 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1820  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.79 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161882  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1633  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.79 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0380198  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  29.44 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2554  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.73 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.964231  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.5 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.5 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  29.08 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0420  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.33 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.505661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1751  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.33 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.04 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3108  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.33 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.690807  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.08 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3436  transposase IS116/IS110/IS902  26.18 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3437  transposase IS116/IS110/IS902  25.87 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222755  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4122  transposase IS116/IS110/IS902  25.87 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  34.84 
 
 
348 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>