More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3520 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  100 
 
 
382 aa  769    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  44.17 
 
 
383 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  44.17 
 
 
383 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  43.35 
 
 
379 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.02 
 
 
383 aa  238  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.98 
 
 
384 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.82 
 
 
326 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.89 
 
 
366 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3938  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.35 
 
 
386 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  43.37 
 
 
379 aa  206  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  43.37 
 
 
379 aa  206  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4315  transposase IS116/IS110/IS902  40.1 
 
 
389 aa  206  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3060  transposase IS116/IS110/IS902  40.06 
 
 
383 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137931  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.01 
 
 
539 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191643  normal  0.811146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1954  transposase IS116/IS110/IS902  37.38 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2773  transposase IS116/IS110/IS902  37.07 
 
 
385 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3995  transposase IS116/IS110/IS902  36.32 
 
 
417 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.55 
 
 
288 aa  107  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  24.05 
 
 
384 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  28.53 
 
 
363 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.53 
 
 
363 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  29.41 
 
 
358 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.46 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.79 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.4 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.4 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.43 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  27.92 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  27.92 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  27.92 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  27.92 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  27.92 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  27.92 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  27.92 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  27.92 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  28.78 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.59 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.59 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.59 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.62 
 
 
372 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  27.55 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  27.55 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  27.55 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  27.55 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  28.24 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  28.24 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  23.23 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.51 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.51 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.51 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.18 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  26.75 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  27.08 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.12 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.71 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.27 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.12 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.12 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.9 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.12 
 
 
347 aa  67  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.61 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.45 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.45 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.47 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  30.37 
 
 
229 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.47 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  27.59 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  28.95 
 
 
343 aa  63.2  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  33.09 
 
 
337 aa  63.2  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  33.09 
 
 
337 aa  63.2  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  27.78 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4120  transposase IS116/IS110/IS902  29.93 
 
 
374 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4496  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.2 
 
 
345 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  27.46 
 
 
296 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  24.83 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.34 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.21 
 
 
342 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.21 
 
 
342 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.21 
 
 
342 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0894579  normal  0.267688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3844  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.21 
 
 
342 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.464911  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.84 
 
 
311 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0740  transposase  26.21 
 
 
307 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0332922  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3767  transposase  26.21 
 
 
307 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5101  transposase  26.21 
 
 
307 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.744435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6332  transposase  26.21 
 
 
307 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7069  transposase  26.21 
 
 
307 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.944245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.69 
 
 
348 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  23.83 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  23.83 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  23.83 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  23.83 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  23.83 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  23.83 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02812  hypothetical protein  25.16 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05053  hypothetical protein  25.16 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08193  transposase  25.16 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01475  hypothetical protein  25.16 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.69 
 
 
348 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  26.62 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.3 
 
 
347 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>