More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7433 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
376 aa  772    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  79.4 
 
 
376 aa  621  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  79.4 
 
 
376 aa  621  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  74.12 
 
 
391 aa  595  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  74.39 
 
 
391 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  74.39 
 
 
391 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  74.39 
 
 
391 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  74.39 
 
 
391 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  74.12 
 
 
391 aa  594  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  74.39 
 
 
391 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  74.39 
 
 
391 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  74.12 
 
 
391 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  74.12 
 
 
391 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  74.12 
 
 
391 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  74.12 
 
 
391 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  78.33 
 
 
359 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  76.47 
 
 
296 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  48.03 
 
 
384 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  48.63 
 
 
384 aa  356  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.9 
 
 
372 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.73 
 
 
370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.73 
 
 
370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.73 
 
 
370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.75 
 
 
369 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.33 
 
 
369 aa  346  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.46 
 
 
369 aa  344  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.46 
 
 
369 aa  344  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.46 
 
 
369 aa  344  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.92 
 
 
366 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  45.6 
 
 
371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  46.22 
 
 
403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.33 
 
 
373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  48.62 
 
 
332 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.33 
 
 
369 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.33 
 
 
369 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  48.04 
 
 
285 aa  282  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  45.17 
 
 
265 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.94 
 
 
361 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  36.34 
 
 
363 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.34 
 
 
363 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4849  transposase IS111A/IS1328/IS1533  73.11 
 
 
134 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0631006 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  45.19 
 
 
229 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  36.88 
 
 
368 aa  160  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  36.88 
 
 
368 aa  160  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.4 
 
 
374 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3840  hypothetical protein  53.03 
 
 
157 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0569729 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  50.66 
 
 
159 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  27.37 
 
 
358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  30.99 
 
 
379 aa  96.3  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  31.59 
 
 
412 aa  92.8  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4617  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.65 
 
 
243 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219004  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03430  transposase  34.31 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.45 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  26.67 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  27.2 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.83 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  26.05 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.65 
 
 
352 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.25 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.7 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.7 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  26.4 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  31.25 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4956  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.29 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440622  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  38.02 
 
 
206 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  27.44 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  27.44 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.34 
 
 
338 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  26.4 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  30.47 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  30.47 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.24 
 
 
343 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.24 
 
 
343 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0488  putative transposase IS116/IS110/IS902  31.17 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296532  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  26.96 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  26.96 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  30.7 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  30.7 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  30.7 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  30.7 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  30.7 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  30.7 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4642  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.73 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.882664  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.68 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.04 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.51 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.51 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.61 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.79 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.48 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  34.48 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2266  transposase IS116/IS110/IS902  31.37 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.36 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  26.84 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  26.84 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  26.84 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.64 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.64 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.88 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0894966  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  25.94 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>