More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2266 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2266  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  82.7 
 
 		 344 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  77.82 
 
 		 347 aa  381  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  76.76 
 
 		 499 aa  377  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  67.93 
 
 		 346 aa  342  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.45 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.45 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.96 
 
 		 311 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.78 
 
 		 338 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  45.3 
 
 		 338 aa  225  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  45.3 
 
 		 338 aa  225  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  45.3 
 
 		 338 aa  225  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  45.3 
 
 		 338 aa  225  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  47.46 
 
 		 338 aa  224  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  47.46 
 
 		 338 aa  224  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  47.46 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  47.46 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  47.46 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  48.47 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  48.72 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  48.72 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  48.72 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.04 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.04 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.02 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.02 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.02 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.02 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.8 
 
 		 340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.593308  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  43.51 
 
 		 341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  43.51 
 
 		 341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  43.59 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.02 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.16 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.19 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0384  putative transposase  44.73 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  44.73 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0375  putative transposase  44.73 
 
 		 345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 342 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  42.86 
 
 		 342 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 342 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  42.86 
 
 		 342 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 342 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  44.64 
 
 		 355 aa  211  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.77 
 
 		 356 aa  211  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.31 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.23 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.23 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  44.68 
 
 		 343 aa  209  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  43.78 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 234 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000966346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 234 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  46.58 
 
 		 338 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  42.74 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.83 
 
 		 338 aa  205  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  43.78 
 
 		 322 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6180  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.02 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626192  hitchhiker  0.00140825 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4956  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.15 
 
 		 341 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5572  transposase IS116/IS110/IS902  44.21 
 
 		 338 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.35 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.35 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.35 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.35 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.3 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2913  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.92 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  46.26 
 
 		 338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.02 
 
 		 338 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.02 
 
 		 338 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02906  probable transposase  44.07 
 
 		 347 aa  199  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142425  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2242  transposase family protein  44.59 
 
 		 455 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860997  normal  0.210427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3762  putative transposase  43.75 
 
 		 341 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.915156 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.02 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  44.58 
 
 		 341 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  44.87 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2485  ISPsy7, transposase  43.17 
 
 		 340 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00294179  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.92 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688347  normal  0.139029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1748  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.92 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.92 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.509366  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2465  ISPsy7, transposase  42.73 
 
 		 340 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0372  ISPsy7, transposase  42.73 
 
 		 340 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2167  ISPsy7, transposase  42.73 
 
 		 340 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3146  ISPsy7, transposase  42.73 
 
 		 340 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0791519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3325  ISPsy7, transposase  42.73 
 
 		 340 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0495526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3746  ISPsy7, transposase  42.73 
 
 		 340 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3800  ISPsy7, transposase  42.73 
 
 		 340 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5571  ISPsy7, transposase  42.73 
 
 		 340 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0377  ISCps1, transposase  41.49 
 
 		 342 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>