More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2552 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  100 
 
 
412 aa  823    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  55.53 
 
 
411 aa  450  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  55.53 
 
 
411 aa  450  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  55.53 
 
 
411 aa  450  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  55.53 
 
 
411 aa  450  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  55.53 
 
 
411 aa  450  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  55.53 
 
 
411 aa  450  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.04 
 
 
411 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60.71 
 
 
378 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.14 
 
 
381 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0442  transposase  57.34 
 
 
380 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.145361  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8273  transposase  53.41 
 
 
186 aa  169  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1437  hypothetical protein  55.33 
 
 
168 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1436  hypothetical protein  57.39 
 
 
237 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  31.82 
 
 
385 aa  136  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  30.65 
 
 
385 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1055  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.05 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.124364  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7300  putative transposase  55.2 
 
 
125 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675476  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.06 
 
 
342 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.06 
 
 
342 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.06 
 
 
342 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.97 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.97 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  30.22 
 
 
414 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.23 
 
 
359 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  28.52 
 
 
414 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  30.79 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0984  hypothetical protein  26.71 
 
 
326 aa  95.1  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  30.79 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  30.79 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  30.79 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  30.79 
 
 
391 aa  95.5  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  30.79 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  30.79 
 
 
391 aa  95.5  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  30.79 
 
 
391 aa  95.5  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  30.79 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  30.79 
 
 
391 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  32.34 
 
 
391 aa  94.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4384  transposase IS116/IS110/IS902  29.59 
 
 
339 aa  93.2  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.59 
 
 
376 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  28.34 
 
 
340 aa  92  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  30.52 
 
 
391 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  28.98 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1270  hypothetical protein  27.93 
 
 
279 aa  90.9  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.251236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2599  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.61 
 
 
341 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3187  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3529  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.61 
 
 
341 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458804  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1224  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.43 
 
 
328 aa  90.5  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.43 
 
 
328 aa  90.5  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1339  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.14 
 
 
328 aa  90.1  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  27.69 
 
 
348 aa  90.1  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1384  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.43 
 
 
328 aa  90.1  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149924  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.05 
 
 
346 aa  89.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1260  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.14 
 
 
328 aa  89  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1550  transposase IS116/IS110/IS902  25.71 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1884  transposase IS116/IS110/IS902  25.71 
 
 
429 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2484  transposase IS116/IS110/IS902  25.71 
 
 
429 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2770  transposase IS116/IS110/IS902  25.71 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.14 
 
 
328 aa  87  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0408  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 
326 aa  86.3  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000108361  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.43 
 
 
328 aa  86.3  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.2 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
340 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.99 
 
 
288 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  25.78 
 
 
355 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
340 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
340 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.89 
 
 
340 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  26.67 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  29.29 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1120  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.14 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0932183  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.82 
 
 
316 aa  84  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.334176  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2345  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.82 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0350  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.82 
 
 
316 aa  84  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.144178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  31.74 
 
 
341 aa  84  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  31.74 
 
 
341 aa  84  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.03 
 
 
350 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  31.74 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  28.91 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.74 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.74 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  28.33 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3130  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.09 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  27.94 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5572  transposase IS116/IS110/IS902  31.9 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.19 
 
 
406 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0736  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.59 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000627011  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.17 
 
 
366 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.05 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  26.56 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.8 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.8 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  27.3 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  26.56 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.22 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.22 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  29.75 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.41 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.22 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.22 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  27.3 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>