More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2811 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
369 aa  744    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
369 aa  744    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  79.84 
 
 
371 aa  611  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  80.66 
 
 
403 aa  610  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.08 
 
 
370 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.08 
 
 
370 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  58.08 
 
 
370 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.89 
 
 
372 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.22 
 
 
373 aa  361  9e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.79 
 
 
369 aa  361  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.79 
 
 
369 aa  361  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.79 
 
 
369 aa  361  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.52 
 
 
369 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.28 
 
 
369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  42.05 
 
 
384 aa  322  5e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  42.11 
 
 
384 aa  319  5e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.81 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.81 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  50.96 
 
 
332 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  43.44 
 
 
391 aa  308  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  43.44 
 
 
391 aa  308  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  43.44 
 
 
391 aa  308  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  43.44 
 
 
391 aa  308  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  43.44 
 
 
391 aa  308  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  43.44 
 
 
391 aa  308  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  43.17 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  43.17 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  43.44 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.33 
 
 
376 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  43.17 
 
 
391 aa  305  8.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  43.17 
 
 
391 aa  305  8.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  43.17 
 
 
391 aa  305  8.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.54 
 
 
366 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.74 
 
 
359 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  47.1 
 
 
265 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  45.58 
 
 
296 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  40.81 
 
 
285 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.52 
 
 
361 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  37.71 
 
 
363 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.71 
 
 
363 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  61.04 
 
 
159 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  39.12 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  39.12 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  41.5 
 
 
229 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3840  hypothetical protein  56.49 
 
 
157 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0569729 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.55 
 
 
374 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  32.59 
 
 
358 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4617  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  58.04 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219004  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  51.33 
 
 
206 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03430  transposase  37.5 
 
 
261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4849  transposase IS111A/IS1328/IS1533  47.9 
 
 
134 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0631006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.62 
 
 
411 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.47 
 
 
342 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.47 
 
 
342 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.47 
 
 
342 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.41 
 
 
350 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  29.13 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  30.07 
 
 
350 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.51 
 
 
342 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.51 
 
 
342 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  26.4 
 
 
411 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  26.4 
 
 
411 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  26.4 
 
 
411 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  26.4 
 
 
411 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  26.4 
 
 
411 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  26.4 
 
 
411 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.81 
 
 
343 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4384  transposase IS116/IS110/IS902  30.33 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.02 
 
 
352 aa  82  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.86 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.5 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  30.8 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.67 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.67 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  30.52 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  26.96 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.36 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  26.06 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.75 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0894966  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01349  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  77  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3945  IS110 family transposase  26.75 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4548  IS110 family transposase  26.75 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.23 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05550  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01775  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05560  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01790  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01381  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00717  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00712  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00972  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01209  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00511  transposase  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03330  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02915  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02799  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01210  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01382  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03439  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03475  hypothetical protein  24.9 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>