More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4548 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3945  IS110 family transposase  100 
 
 		 344 aa  707    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4548  IS110 family transposase  100 
 
 		 344 aa  707    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.38 
 
 		 344 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0894966  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2696  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.12 
 
 		 342 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000117153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1525  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.82 
 
 		 342 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.554146  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4650  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.53 
 
 		 342 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4334  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.53 
 
 		 342 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2350  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.53 
 
 		 342 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467502  normal  0.925611 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.53 
 
 		 342 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  42.86 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  42.86 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  42.86 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  42.86 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.64 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.64 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.64 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.64 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.64 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.64 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.64 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.64 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.92 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.62 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.62 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.62 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.37 
 
 		 338 aa  272  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  41.92 
 
 		 338 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 		 338 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 337 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  42.99 
 
 		 337 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.77 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.77 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.77 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0590738  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.29 
 
 		 337 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.29 
 
 		 337 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  41.81 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.42 
 
 		 338 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  42.18 
 
 		 338 aa  262  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  42.18 
 
 		 338 aa  262  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01349  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05550  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01209  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00718  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00717  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01210  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01382  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01381  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01790  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01775  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00972  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00511  transposase  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00712  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  41.89 
 
 		 338 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  41.89 
 
 		 338 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  41.89 
 
 		 338 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02799  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02915  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03439  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03330  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05560  hypothetical protein  40.91 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.07 
 
 		 341 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.07 
 
 		 341 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.65 
 
 		 499 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43 
 
 		 302 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03475  hypothetical protein  40.61 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  41.27 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.18 
 
 		 311 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.28 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.32 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0928  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.99 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.99 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2273  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.99 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.508057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3552  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.99 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.99 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4139  transposase IS116/IS110/IS902  39.57 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.02 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.96 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.96 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.22 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.22 
 
 		 344 aa  245  8e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1839  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1963  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1231  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1361  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0007  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0330  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000188022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1595  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000374661  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0854  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00143492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1033  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1256  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1296  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201015  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1338  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00487008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1389  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1406  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0495  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1848  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0668  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0714  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0847  transposase for insertion sequence element IS1111A  39.04 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>