More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2565 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 358 aa  731    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.05 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.59 
 
 		 369 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.59 
 
 		 369 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.23 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.06 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.48 
 
 		 369 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.48 
 
 		 369 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.48 
 
 		 369 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  29.36 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.51 
 
 		 376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.51 
 
 		 376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  29.36 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  29.36 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  29.36 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  29.36 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  29.36 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  29.36 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  29.09 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.11 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.11 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.11 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  29.09 
 
 		 391 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  29.09 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  29.09 
 
 		 391 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  29.09 
 
 		 391 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.55 
 
 		 359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  31.68 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  28.57 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  28.57 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.29 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.37 
 
 		 376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.65 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.13 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  30.59 
 
 		 384 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  30.1 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.1 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  29.89 
 
 		 265 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  25.75 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  26.67 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  26.67 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  25.22 
 
 		 346 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  25.22 
 
 		 348 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.22 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.71 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4496  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.24 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.03 
 
 		 347 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.77 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  29.7 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  29.7 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.22 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.72 
 
 		 348 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.72 
 
 		 348 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.4 
 
 		 383 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  26.92 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.9 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.9 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.9 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1575  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.9 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0511159  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.17 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  28.87 
 
 		 296 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  24.1 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  24.1 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  24.1 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  24.1 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  24.1 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  24.1 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  27.88 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  27.88 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  26.28 
 
 		 340 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.8 
 
 		 367 aa  86.7  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.8 
 
 		 343 aa  86.7  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.43 
 
 		 343 aa  86.3  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.93 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.93 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.93 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0894579  normal  0.267688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3844  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.93 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.464911  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.37 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.37 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.37 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.37 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0880  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.37 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133961  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0377  ISCps1, transposase  25.68 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417861  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.95 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.6 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.6 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.6 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0590738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.04 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.04 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.04 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.04 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.89 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.89 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0372  ISPsy7, transposase  26.13 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2167  ISPsy7, transposase  26.13 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2465  ISPsy7, transposase  26.13 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2485  ISPsy7, transposase  26.13 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00294179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3800  ISPsy7, transposase  26.13 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1095  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>