More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0234 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 366 aa  744    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.66 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.83 
 
 		 369 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.83 
 
 		 369 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.83 
 
 		 369 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.83 
 
 		 369 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  47.78 
 
 		 391 aa  340  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  47.78 
 
 		 391 aa  340  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  47.78 
 
 		 391 aa  340  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  47.78 
 
 		 391 aa  339  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  47.78 
 
 		 391 aa  339  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  47.78 
 
 		 391 aa  339  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  47.78 
 
 		 391 aa  339  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  47.78 
 
 		 391 aa  339  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  47.78 
 
 		 391 aa  339  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  47.5 
 
 		 391 aa  338  9e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  47.5 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  47.62 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.33 
 
 		 376 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.33 
 
 		 376 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.65 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.65 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.65 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.41 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.92 
 
 		 376 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.34 
 
 		 373 aa  322  8e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  44.81 
 
 		 371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  44.81 
 
 		 403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  49.24 
 
 		 332 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  43.45 
 
 		 384 aa  302  7.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.54 
 
 		 369 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.54 
 
 		 369 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.75 
 
 		 359 aa  291  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  39 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  49.29 
 
 		 296 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  45.86 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  47.73 
 
 		 265 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.74 
 
 		 361 aa  202  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  37.08 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.08 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  34.04 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  34.04 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.24 
 
 		 374 aa  150  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  38.1 
 
 		 229 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  49.34 
 
 		 159 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  32.06 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3840  hypothetical protein  52.31 
 
 		 157 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0569729 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4849  transposase IS111A/IS1328/IS1533  46.22 
 
 		 134 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0631006 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03430  transposase  32.81 
 
 		 261 aa  99.8  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.47 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4617  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  42.64 
 
 		 243 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219004  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  33.09 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  33.09 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  30.31 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.33 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  26.49 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  26.16 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  26.17 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.16 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  26.1 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  26.1 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  26.1 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  26.1 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  26.1 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  26.1 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.9 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.28 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  37.17 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  29.58 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.85 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.39 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.39 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0334  ISPpu11, transposase  24.8 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.229017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3498  ISPpu11, transposase  24.8 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.44 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0894966  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3945  IS110 family transposase  24.84 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4548  IS110 family transposase  24.84 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.95 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.76 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4384  transposase IS116/IS110/IS902  28.57 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.07 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.07 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  26.96 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1559  transposase for IS1663  23.5 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0373  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.3 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0910679  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.04 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000103198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.04 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.04 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.100953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.04 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7069  transposase  28.03 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.944245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5101  transposase  28.03 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6332  transposase  28.03 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0740  transposase  28.03 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0332922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5311  transposase  28.03 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414868  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3767  transposase  28.03 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0639  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.97 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611621  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7964  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.97 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00546664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3243  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.65 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.33 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1462  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.65 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>