More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06779 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  792    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  75 
 
 
384 aa  614  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02603  hypothetical protein  99.65 
 
 
285 aa  579  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  98.5 
 
 
229 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.18 
 
 
370 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.18 
 
 
370 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.18 
 
 
370 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.73 
 
 
376 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.73 
 
 
376 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.03 
 
 
376 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.64 
 
 
372 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.41 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.27 
 
 
369 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.27 
 
 
369 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.27 
 
 
369 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.86 
 
 
369 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.45 
 
 
373 aa  350  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  47.14 
 
 
391 aa  347  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  47.14 
 
 
391 aa  347  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  47.14 
 
 
391 aa  347  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  47.14 
 
 
391 aa  347  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  47.14 
 
 
391 aa  347  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  47.14 
 
 
391 aa  347  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  47.14 
 
 
391 aa  347  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  46.45 
 
 
391 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  46.87 
 
 
391 aa  344  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  46.87 
 
 
391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  46.87 
 
 
391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  46.87 
 
 
391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.05 
 
 
369 aa  322  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.05 
 
 
369 aa  322  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  51.1 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.24 
 
 
359 aa  316  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  42.43 
 
 
371 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  42.98 
 
 
403 aa  311  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.45 
 
 
366 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0795  putative transposase IS116/IS110/IS902  51.25 
 
 
296 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  49.81 
 
 
265 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.16 
 
 
361 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  30.87 
 
 
363 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.87 
 
 
363 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  50 
 
 
159 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  32.34 
 
 
368 aa  145  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  32.34 
 
 
368 aa  145  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3840  hypothetical protein  51.56 
 
 
157 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0569729 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.67 
 
 
374 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4849  transposase IS111A/IS1328/IS1533  50 
 
 
134 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0631006 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4617  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  47.83 
 
 
243 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219004  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02602  hypothetical protein  94.74 
 
 
99 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  25.75 
 
 
358 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  28.18 
 
 
411 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  28.18 
 
 
411 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  28.18 
 
 
411 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  28.18 
 
 
411 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  28.18 
 
 
411 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  28.18 
 
 
411 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.55 
 
 
411 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  38.33 
 
 
206 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03430  transposase  30.35 
 
 
261 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00712  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03330  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01210  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00511  transposase  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00718  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00717  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01382  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03439  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01790  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01209  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05550  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00972  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01775  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01381  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05560  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02915  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02799  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01349  hypothetical protein  25.66 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03475  hypothetical protein  26.8 
 
 
341 aa  87.8  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.1 
 
 
338 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  28.33 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.56 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.47 
 
 
499 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.28 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.25 
 
 
344 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.32 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  25.97 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  25.97 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  25.97 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  25.97 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.25 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  22.94 
 
 
379 aa  77  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  22.94 
 
 
379 aa  77  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4334  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.25 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.25 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.67 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4650  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.25 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2350  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.25 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467502  normal  0.925611 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01262  hypothetical protein  26.22 
 
 
266 aa  77  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.67 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  26.81 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>