More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5197 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 383 aa  773    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  47.83 
 
 		 379 aa  322  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  47.83 
 
 		 379 aa  322  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3060  transposase IS116/IS110/IS902  45.36 
 
 		 383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3995  transposase IS116/IS110/IS902  46.92 
 
 		 417 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4315  transposase IS116/IS110/IS902  47.3 
 
 		 389 aa  306  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.92 
 
 		 539 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191643  normal  0.811146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.46 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.63 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  40.63 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  43.44 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  43.44 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3938  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1954  transposase IS116/IS110/IS902  41.89 
 
 		 385 aa  250  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2773  transposase IS116/IS110/IS902  41.62 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  37.02 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.25 
 
 		 288 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  30.66 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  29.4 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  27.97 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.97 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.97 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.97 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.97 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.97 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  29.09 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  29.09 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  29.09 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  29.09 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  29.09 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  29.09 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  29.09 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  29.09 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  29.09 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  29.09 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  30.17 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  28.79 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.73 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.73 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.83 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  28.79 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.96 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.68 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.28 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.66 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  28.95 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  28.95 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1575  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.59 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0511159  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.59 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2657  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.69 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.69 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0803488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  27.48 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.7 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.59 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.59 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  26.22 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.36 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.36 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3079  transposase IS116/IS110/IS902  29.63 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3085  transposase IS116/IS110/IS902  29.63 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  29.87 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  26.8 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12452  transposase  28.18 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.267636 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.89 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.22 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.22 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.22 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.22 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.19 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.19 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.19 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.19 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  28.45 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.64 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.64 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.53 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0567a  transposase  27.5 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.569839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.25 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.25 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3155  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.19 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0223a  transposase  27.5 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0354b  transposase  27.5 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.65 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0493a  transposase  27.5 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.25 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  28.1 
 
 		 340 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.25 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1685a  transposase  27.5 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000151302  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0007  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1568  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0135752  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1529  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251179  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1419  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1839  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.03 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1033  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0854  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00143492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0124  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1231  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1256  transposase for insertion sequence element IS1111A  27.27 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>