More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3938 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3938  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 		 386 aa  757    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.56 
 
 		 384 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3995  transposase IS116/IS110/IS902  47.84 
 
 		 417 aa  309  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4315  transposase IS116/IS110/IS902  49.73 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.65 
 
 		 539 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191643  normal  0.811146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2773  transposase IS116/IS110/IS902  44.17 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3060  transposase IS116/IS110/IS902  44.54 
 
 		 383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1954  transposase IS116/IS110/IS902  43.75 
 
 		 385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.15 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  45.5 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  45.5 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.07 
 
 		 366 aa  260  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  41.69 
 
 		 379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  42.32 
 
 		 383 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  42.32 
 
 		 383 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  42.18 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.64 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  27.66 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  28.25 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3079  transposase IS116/IS110/IS902  28.91 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3085  transposase IS116/IS110/IS902  28.91 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  30.88 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  30.88 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  30.16 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.08 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  26.33 
 
 		 322 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.3 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.37 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1055  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.5 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.124364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.37 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.92 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.37 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.37 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.92 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  25.73 
 
 		 343 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  25.73 
 
 		 343 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  25.73 
 
 		 343 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  25.73 
 
 		 343 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  25.73 
 
 		 343 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  25.73 
 
 		 343 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.99 
 
 		 373 aa  67  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.3 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  25.73 
 
 		 343 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  27.45 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.17 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.88 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09760  Transposase, IS111A/IS1328/IS1533  30 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.81 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.72 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  28.9 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.9 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.9 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.9 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.9 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.9 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.65 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  31.15 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.1 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.32 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.63 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.63 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.63 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  25.38 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  25.38 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  25.38 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  25.38 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  25.38 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  28.34 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.34 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  25.38 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  25.08 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  32.6 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  32.6 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  32.6 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.63 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.63 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.79 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.46 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  27.1 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  25.08 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3155  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.23 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.23 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.914842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  30.8 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  23.69 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  28.03 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  24.77 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.85 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0965  transposase IS116/IS110/IS902  28.4 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1574  transposase IS116/IS110/IS902  28.4 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1966  transposase IS116/IS110/IS902  28.4 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2010  transposase IS116/IS110/IS902  28.4 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.657114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2061  transposase IS116/IS110/IS902  28.4 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232183  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2092  transposase IS116/IS110/IS902  28.4 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3124  transposase IS116/IS110/IS902  28.4 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3160  transposase IS116/IS110/IS902  28.4 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0233772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  27.36 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  25.38 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  25.38 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.85 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>