More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3437 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2124  transposase IS116/IS110/IS902  93.45 
 
 		 412 aa  718    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3436  transposase IS116/IS110/IS902  99.76 
 
 		 412 aa  833    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3437  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 412 aa  836    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4122  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 412 aa  836    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1959  transposase IS116/IS110/IS902  52.44 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.945198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1024  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2366  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.18 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000113167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0589  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.18 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.18 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3853  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.18 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1960  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.62 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.261169  normal  0.0163724 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.7 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6342  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.06 
 
 		 408 aa  353  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6341  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.06 
 
 		 408 aa  353  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0725  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.57 
 
 		 411 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2321  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.69 
 
 		 406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2322  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.69 
 
 		 406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.69 
 
 		 406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.62 
 
 		 406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.23 
 
 		 402 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.5 
 
 		 542 aa  328  9e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.5 
 
 		 540 aa  328  9e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.5 
 
 		 540 aa  328  9e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.5 
 
 		 540 aa  328  9e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0407  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.76 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.76 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3921  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.76 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.174408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4655  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.76 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.76 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0957  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.17 
 
 		 423 aa  326  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5208  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.17 
 
 		 423 aa  326  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.17 
 
 		 423 aa  326  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1319  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.17 
 
 		 423 aa  326  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622627  normal  0.467675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.17 
 
 		 423 aa  326  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127954  hitchhiker  0.00882366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.71 
 
 		 408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3223  transposase  60.64 
 
 		 248 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327091  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.79 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.79 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.79 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.79 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.79 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.79 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0130  transposase IS116/IS110/IS902  43.95 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3130  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.47 
 
 		 378 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.07 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2090  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.93 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104804  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1287  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.11 
 
 		 465 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324635  normal  0.577676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.47 
 
 		 466 aa  266  7e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.198929  normal  0.0124292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2232  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.47 
 
 		 466 aa  266  7e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000585875  normal  0.443218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0087  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.47 
 
 		 466 aa  266  7e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.89 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.425839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1282  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.89 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124375  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2973  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.89 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0717724  normal  0.0172565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.89 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.89 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4398  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.89 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2317  hypothetical protein  81.65 
 
 		 310 aa  259  9e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097002  normal  0.0149356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3494  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.45 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.207887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0326  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.07 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1225  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.07 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.07 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.235324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.07 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402524  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.07 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000616647 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3370  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.07 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3374  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.07 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.495996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3377  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.07 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3378  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.07 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.195678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3403  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.07 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0158163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3441  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.07 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4041  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.07 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.07 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  37.05 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  37.05 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  37.05 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  37.05 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  37.05 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  37.05 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  37.05 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  37.05 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12452  transposase  42.81 
 
 		 333 aa  235  9e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.267636 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1223  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.89 
 
 		 310 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2958  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.5 
 
 		 483 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14300  transposase IS116/IS110/IS902  35.42 
 
 		 392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0286  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.02 
 
 		 441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150235  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.56 
 
 		 442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5544  transposase IS116/IS110/IS902  29.78 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.362719 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0024  transposase  30.65 
 
 		 454 aa  190  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4136  transposase  30.41 
 
 		 446 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3738  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.96 
 
 		 453 aa  186  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1133  ISPpu9, transposase  31.12 
 
 		 442 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1260  ISPpu9, transposase  31.12 
 
 		 442 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.469395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4603  ISPpu9, transposase  31.12 
 
 		 442 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.79364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4791  ISPpu9, transposase  31.12 
 
 		 442 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2570  ISPpu9, transposase  31.12 
 
 		 442 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3381  ISPpu9, transposase  31.12 
 
 		 442 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3586  ISPpu9, transposase  31.12 
 
 		 442 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4948  transposase IS111A/IS1328/IS1533  48.9 
 
 		 188 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>