83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8273 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8273  transposase  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7300  putative transposase  92.5 
 
 		 125 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675476  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  49.71 
 
 		 411 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  49.71 
 
 		 411 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  49.71 
 
 		 411 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  49.71 
 
 		 411 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  49.71 
 
 		 411 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  49.71 
 
 		 411 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  53.41 
 
 		 412 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.15 
 
 		 411 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.33 
 
 		 378 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0442  transposase  52.82 
 
 		 380 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.145361  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.41 
 
 		 381 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1436  hypothetical protein  55.21 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  32.63 
 
 		 385 aa  92  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  33.52 
 
 		 385 aa  91.7  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.71 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.71 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.71 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5379  putative transposase for insertion sequence element  32.94 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1055  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.73 
 
 		 307 aa  64.7  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.124364  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3686  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.59 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.59 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1548  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.59 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.59 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5440  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.59 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1861  hypothetical protein  30.83 
 
 		 331 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1809  hypothetical protein  30.83 
 
 		 331 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.400099  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1484  hypothetical protein  30.83 
 
 		 331 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4247  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.28 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  29.1 
 
 		 406 aa  51.6  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  29.1 
 
 		 406 aa  51.6  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4384  transposase IS116/IS110/IS902  28.49 
 
 		 339 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  27.37 
 
 		 384 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08189  transposase  27.27 
 
 		 229 aa  48.5  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3116  transposase  27.59 
 
 		 265 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.83 
 
 		 373 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.33 
 
 		 369 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.33 
 
 		 369 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  26.06 
 
 		 414 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.46 
 
 		 372 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  23.08 
 
 		 414 aa  44.7  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.05 
 
 		 369 aa  44.7  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2770  transposase IS116/IS110/IS902  27.32 
 
 		 429 aa  44.7  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2484  transposase IS116/IS110/IS902  27.32 
 
 		 429 aa  44.7  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1884  transposase IS116/IS110/IS902  27.32 
 
 		 429 aa  44.7  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1550  transposase IS116/IS110/IS902  27.32 
 
 		 429 aa  44.7  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.05 
 
 		 369 aa  44.7  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.05 
 
 		 369 aa  44.7  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3529  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.5 
 
 		 341 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458804  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2599  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.5 
 
 		 341 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3187  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2031  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.27 
 
 		 343 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.14 
 
 		 406 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  25.97 
 
 		 332 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  29.52 
 
 		 371 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  29.52 
 
 		 403 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0279  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.46 
 
 		 360 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.456081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0859  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.46 
 
 		 360 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.46 
 
 		 360 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.43 
 
 		 393 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3855  haem catalase/peroxidase  20.12 
 
 		 377 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3462  ISGsu4, transposase  20.12 
 
 		 377 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0104746 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.84 
 
 		 339 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.84 
 
 		 339 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.100953  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  20.12 
 
 		 377 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.651715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1833  Heme exporter protein CcmA  20.12 
 
 		 377 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.84 
 
 		 339 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000103198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.84 
 
 		 339 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.15 
 
 		 340 aa  42  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.15 
 
 		 340 aa  42  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.73 
 
 		 314 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1602  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.73 
 
 		 314 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4517  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  33.33 
 
 		 320 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000931512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 		 314 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 		 314 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.934881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4455  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  33.33 
 
 		 320 aa  41.6  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3077  response regulator receiver domain-containing protein  19.51 
 
 		 377 aa  41.6  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4514  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  33.33 
 
 		 320 aa  41.6  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.654029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0788  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  33.33 
 
 		 320 aa  41.6  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.07 
 
 		 366 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3420  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.58 
 
 		 322 aa  41.2  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2346  arginyl-tRNA synthetase, class Ic  19.51 
 
 		 397 aa  41.2  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.38 
 
 		 369 aa  41.2  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>