125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1861 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1484  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  681    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1809  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  681    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.400099  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1861  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  681    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.03 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  23.08 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3381  hypothetical protein  24.54 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1095  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.56 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  22.58 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  31.86 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3900  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  27.87 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528596  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.34 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  22.93 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.651715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3855  haem catalase/peroxidase  22.64 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  23.34 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.65 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2346  arginyl-tRNA synthetase, class Ic  22.15 
 
 		 397 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3077  response regulator receiver domain-containing protein  22.15 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.09 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.09 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  21.8 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1575  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  21.8 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0511159  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8273  transposase  30.83 
 
 		 186 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1833  Heme exporter protein CcmA  22.15 
 
 		 377 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3462  ISGsu4, transposase  22.15 
 
 		 377 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0104746 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3111  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.12 
 
 		 347 aa  53.5  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.609339  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.67 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24 
 
 		 374 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  23.93 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  23.93 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08192  transposase  22.44 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  21.71 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  24.16 
 
 		 381 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4120  transposase IS116/IS110/IS902  22.22 
 
 		 374 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  29.27 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01926  hypothetical protein  22.44 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02006  hypothetical protein  22.44 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05219  hypothetical protein  22.44 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.58 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.58 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.58 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.58 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.09 
 
 		 343 aa  49.7  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4651  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.09 
 
 		 343 aa  49.7  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.11 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.11 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0532  putative transposase  22.9 
 
 		 349 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0538  putative transposase  20.48 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.88 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  25.47 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  25.47 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  25.47 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  25.47 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  25.47 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  25.47 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.61 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.61 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.88 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.976951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  30.84 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3254  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.58 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0923362  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3331  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.58 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1430  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.58 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2583  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.58 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1421  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.58 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0590  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.58 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2671  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.58 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.58 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.29 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.334176  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0350  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.29 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.144178  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2345  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.29 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2997  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.77 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00357301  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5206  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.81 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0981183  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0729  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.68 
 
 		 427 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.876532 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.67 
 
 		 376 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.67 
 
 		 376 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3061  hypothetical protein  27.27 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1800  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.68 
 
 		 427 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5999  ISPpu9, transposase  27.27 
 
 		 451 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5586  ISPpu9, transposase  27.27 
 
 		 451 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1055  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.96 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.124364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1822  ISPpu9, transposase  27.27 
 
 		 451 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3062  ISPpu9, transposase  27.27 
 
 		 451 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.231592  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1941  ISPpu9, transposase  27.27 
 
 		 451 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.93243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3247  ISPpu9, transposase  27.27 
 
 		 451 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1828  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.68 
 
 		 403 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3473  hypothetical protein  25.68 
 
 		 403 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0880625 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3521  hypothetical protein  25.68 
 
 		 403 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880505 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3558  hypothetical protein  25.68 
 
 		 403 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3962  hypothetical protein  25.68 
 
 		 403 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.462715  normal  0.0823882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0896  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.71 
 
 		 404 aa  46.2  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0420  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.38 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.505661 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.42 
 
 		 381 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3253  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.71 
 
 		 404 aa  46.2  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2886  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.71 
 
 		 404 aa  46.2  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3901  transposase IS111A/IS1328/IS1533  30.71 
 
 		 404 aa  46.2  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1385  putative transposase or inactivated derivative  19.45 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  22.78 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1751  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.38 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3108  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.38 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.690807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4628  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.83 
 
 		 420 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  21.76 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>