More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3532 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
309 aa  607  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
309 aa  607  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1548  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.68 
 
 
309 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3686  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.68 
 
 
309 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5440  transposase IS111A/IS1328/IS1533  95.49 
 
 
244 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.78 
 
 
314 aa  279  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1602  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.78 
 
 
314 aa  279  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.45 
 
 
314 aa  277  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.934881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.45 
 
 
314 aa  277  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7866  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 
315 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4794  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 
315 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1179  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 
315 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5832  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 
315 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236486  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8696  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 
315 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0045  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.71 
 
 
318 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0046  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.71 
 
 
318 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0094  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.71 
 
 
318 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.05206  hitchhiker  0.00363531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0132  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.71 
 
 
318 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0760311  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0488  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.71 
 
 
318 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0670  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.71 
 
 
318 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.375238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0723  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.71 
 
 
318 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0958  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.71 
 
 
318 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1143  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.71 
 
 
318 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1718  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.71 
 
 
318 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00396754  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2073  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.71 
 
 
318 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000159022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2810  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.71 
 
 
318 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2975  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.71 
 
 
318 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3429  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  43.71 
 
 
318 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2517  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.97 
 
 
322 aa  246  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2742  ISCps7, transposase  38.61 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3420  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.97 
 
 
322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.81 
 
 
316 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0987071  normal  0.815394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.45 
 
 
316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0925  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.65 
 
 
320 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94053  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3309  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.46 
 
 
320 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0284  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.13 
 
 
316 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0292  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.13 
 
 
316 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.13 
 
 
316 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.13 
 
 
316 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0348953  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3185  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.13 
 
 
316 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3800  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.13 
 
 
316 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.834348  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4477  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.13 
 
 
316 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2558  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.46 
 
 
320 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2915  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.32 
 
 
320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2763  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.81 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0660856  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1134  transposase IS116/IS110/IS902  37.54 
 
 
323 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3125  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43 
 
 
320 aa  232  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618983  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0856  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.59 
 
 
318 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4407  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.48 
 
 
316 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.497846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2843  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.65 
 
 
320 aa  229  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4455  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  44.12 
 
 
320 aa  229  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0072  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.97 
 
 
320 aa  228  9e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413963  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3803  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.97 
 
 
320 aa  228  9e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1511  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.97 
 
 
320 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0532296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3496  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.09 
 
 
318 aa  225  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.118492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0388  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.09 
 
 
318 aa  225  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2289  transposase IS111A/IS1328/IS1533  37.09 
 
 
318 aa  225  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3822  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.27 
 
 
316 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357564  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4084  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.27 
 
 
316 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0821  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.79 
 
 
320 aa  225  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0840  transposase IS116/IS110/IS902  37.09 
 
 
318 aa  225  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0862  transposase IS116/IS110/IS902  37.09 
 
 
318 aa  225  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.595658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1845  transposase IS116/IS110/IS902  37.09 
 
 
318 aa  225  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1950  transposase IS116/IS110/IS902  37.09 
 
 
318 aa  225  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0873071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2653  transposase IS116/IS110/IS902  37.09 
 
 
318 aa  225  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3756  transposase IS116/IS110/IS902  37.09 
 
 
318 aa  225  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.723193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0619  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.46 
 
 
320 aa  225  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0564215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.06 
 
 
316 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1204  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.46 
 
 
320 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.89173  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2238  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.34 
 
 
321 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0634  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.25 
 
 
316 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1115  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.25 
 
 
316 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840923  normal  0.908147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1394  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.25 
 
 
316 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164924  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1512  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.25 
 
 
316 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.249942 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1946  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.25 
 
 
316 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0175494  decreased coverage  0.00353589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2020  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.25 
 
 
316 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00925904  normal  0.0355962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2502  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.25 
 
 
316 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  0.030374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2605  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.25 
 
 
316 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.978061  normal  0.958241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3229  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.25 
 
 
316 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4264  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.25 
 
 
316 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4107  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.34 
 
 
321 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190664  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5809  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.34 
 
 
321 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  hitchhiker  0.000316639 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3440  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.34 
 
 
321 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3523  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.34 
 
 
321 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1041  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.32 
 
 
320 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2920  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.32 
 
 
320 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2833  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.46 
 
 
320 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000442948  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0788  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.32 
 
 
320 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0870  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.32 
 
 
320 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3882  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.32 
 
 
320 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0777  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.32 
 
 
320 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341483  normal  0.825229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2900  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.32 
 
 
320 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3874  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.46 
 
 
320 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2280  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.14 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3255  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  hitchhiker  0.00658118 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1737  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.14 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183684  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4589  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43 
 
 
320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3703  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0584  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43.14 
 
 
320 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0433  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  43 
 
 
320 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>