123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1437 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1437  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  338  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  75.15 
 
 		 411 aa  250  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  75.15 
 
 		 411 aa  250  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  75.15 
 
 		 411 aa  250  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  75.15 
 
 		 411 aa  250  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  75.15 
 
 		 411 aa  250  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  75.15 
 
 		 411 aa  250  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0442  transposase  80.13 
 
 		 380 aa  241  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.145361  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  77.99 
 
 		 411 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  76.62 
 
 		 381 aa  226  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  55.84 
 
 		 412 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.35 
 
 		 378 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  40.23 
 
 		 414 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  37.93 
 
 		 414 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0804  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.57 
 
 		 374 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3820  hypothetical protein  41.57 
 
 		 346 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.930447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  38.14 
 
 		 343 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4338  hypothetical protein  41.57 
 
 		 348 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.589616  normal  0.0891494 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0464  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.08 
 
 		 332 aa  48.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  36.08 
 
 		 343 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  36.08 
 
 		 343 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  36.08 
 
 		 343 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  36.08 
 
 		 343 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  36.08 
 
 		 343 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  36.08 
 
 		 343 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  36.08 
 
 		 343 aa  47.8  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  32.95 
 
 		 337 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  32.95 
 
 		 337 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0504  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.23 
 
 		 337 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0754  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.23 
 
 		 337 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0914  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.23 
 
 		 337 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.694774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3024  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.23 
 
 		 337 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.923031 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4496  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.11 
 
 		 345 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0504708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  37.21 
 
 		 348 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.83 
 
 		 337 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  36.36 
 
 		 338 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8254  transposase  34.83 
 
 		 340 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0843801  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.93 
 
 		 340 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.93 
 
 		 340 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.93 
 
 		 340 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.93 
 
 		 340 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0853  transposase IS116/IS110/IS902  37.5 
 
 		 363 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0549911 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.52 
 
 		 356 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0928  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.23 
 
 		 337 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.23 
 
 		 337 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2273  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.23 
 
 		 337 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.508057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.23 
 
 		 337 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3552  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.23 
 
 		 337 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  53.66 
 
 		 391 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.52 
 
 		 356 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.63 
 
 		 340 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.63 
 
 		 340 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  53.66 
 
 		 391 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  53.66 
 
 		 391 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  53.66 
 
 		 391 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  53.66 
 
 		 391 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  53.66 
 
 		 391 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  53.66 
 
 		 391 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  53.66 
 
 		 391 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  53.66 
 
 		 391 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  53.66 
 
 		 391 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  53.66 
 
 		 391 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.27 
 
 		 343 aa  44.3  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.36 
 
 		 311 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.27 
 
 		 367 aa  44.3  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  32.18 
 
 		 358 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08193  transposase  32.22 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01475  hypothetical protein  32.22 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02599  hypothetical protein  32.95 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02812  hypothetical protein  32.22 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05053  hypothetical protein  32.22 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.83 
 
 		 338 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0984  hypothetical protein  29.89 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3994  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.08 
 
 		 347 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0740  transposase  37.5 
 
 		 307 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0332922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3767  transposase  37.5 
 
 		 307 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5101  transposase  37.5 
 
 		 307 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6332  transposase  37.5 
 
 		 307 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7069  transposase  37.5 
 
 		 307 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.944245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0587  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.63 
 
 		 362 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0703  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.63 
 
 		 362 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0753  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.63 
 
 		 362 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2874  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.63 
 
 		 362 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3008  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.63 
 
 		 362 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4009  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.63 
 
 		 362 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.143996 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  51.22 
 
 		 391 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0338  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.03 
 
 		 348 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.03 
 
 		 348 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847555 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.54 
 
 		 542 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  35.42 
 
 		 343 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.54 
 
 		 540 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.54 
 
 		 540 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.54 
 
 		 540 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2266  transposase IS116/IS110/IS902  34.09 
 
 		 284 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.82 
 
 		 337 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.82 
 
 		 337 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  37.5 
 
 		 322 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.23 
 
 		 338 aa  42  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0547  transposase  37.5 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  38.1 
 
 		 379 aa  41.2  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>