48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02021 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05219  hypothetical protein  96.47 
 
 
347 aa  179  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02006  hypothetical protein  96.47 
 
 
347 aa  179  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01926  hypothetical protein  96.47 
 
 
347 aa  179  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08192  transposase  96.47 
 
 
347 aa  179  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01474  hypothetical protein  96.47 
 
 
207 aa  177  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02021  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  177  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06781  hypothetical protein  96.47 
 
 
147 aa  174  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02815  hypothetical protein  96.47 
 
 
147 aa  174  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00618  ISGsu4, transposase  75.29 
 
 
329 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00628  ISGsu4, transposase  75.29 
 
 
238 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000155742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  81.18 
 
 
347 aa  129  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4722  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  81.18 
 
 
347 aa  129  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0532  putative transposase  69.41 
 
 
349 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0538  putative transposase  68.67 
 
 
349 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  76.47 
 
 
347 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  75.29 
 
 
347 aa  124  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  75.29 
 
 
347 aa  124  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1385  putative transposase or inactivated derivative  67.47 
 
 
349 aa  124  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2591  ISGsu5, transposase  72.37 
 
 
260 aa  124  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2599  ISGsu4, transposase  64.71 
 
 
348 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0961  ISGsu4, transposase  64.71 
 
 
348 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2346  arginyl-tRNA synthetase, class Ic  54.12 
 
 
397 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3077  response regulator receiver domain-containing protein  54.12 
 
 
377 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3462  ISGsu4, transposase  52.94 
 
 
377 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0104746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  52.94 
 
 
377 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.651715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1833  Heme exporter protein CcmA  52.94 
 
 
377 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3855  haem catalase/peroxidase  51.76 
 
 
377 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0576  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.44 
 
 
263 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.33 
 
 
339 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.33 
 
 
339 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.100953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.33 
 
 
339 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000103198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.33 
 
 
339 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.33 
 
 
360 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0859  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.33 
 
 
360 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0279  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.33 
 
 
360 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.456081  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.33 
 
 
540 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.33 
 
 
540 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.33 
 
 
540 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.33 
 
 
542 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5379  putative transposase for insertion sequence element  29.73 
 
 
208 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.78 
 
 
342 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.78 
 
 
342 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.78 
 
 
342 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1029  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.43 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  36.99 
 
 
385 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  35.62 
 
 
385 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2393  ISGsu5, transposase, truncation  61.54 
 
 
198 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1223  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  30.77 
 
 
310 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>