29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02604 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02604  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  192  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02006  hypothetical protein  98.41 
 
 
347 aa  139  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05219  hypothetical protein  98.41 
 
 
347 aa  139  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01926  hypothetical protein  98.41 
 
 
347 aa  139  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08192  transposase  96.83 
 
 
347 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01474  hypothetical protein  98.41 
 
 
207 aa  134  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06781  hypothetical protein  98.41 
 
 
147 aa  133  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02815  hypothetical protein  98.41 
 
 
147 aa  133  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4722  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  66.67 
 
 
347 aa  99.4  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  66.67 
 
 
347 aa  99.4  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  66.67 
 
 
347 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  66.67 
 
 
347 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  65.08 
 
 
347 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0961  ISGsu4, transposase  55.56 
 
 
348 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2599  ISGsu4, transposase  55.56 
 
 
348 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3855  haem catalase/peroxidase  52.17 
 
 
377 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3077  response regulator receiver domain-containing protein  52.17 
 
 
377 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2346  arginyl-tRNA synthetase, class Ic  52.17 
 
 
397 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  52.17 
 
 
377 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.651715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3462  ISGsu4, transposase  52.17 
 
 
377 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0104746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1833  Heme exporter protein CcmA  52.17 
 
 
377 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2393  ISGsu5, transposase, truncation  49.21 
 
 
198 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2591  ISGsu5, transposase  49.21 
 
 
260 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0532  putative transposase  52.38 
 
 
349 aa  83.6  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0538  putative transposase  49.21 
 
 
349 aa  80.1  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1385  putative transposase or inactivated derivative  46.03 
 
 
349 aa  74.7  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00618  ISGsu4, transposase  54.55 
 
 
329 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00628  ISGsu4, transposase  54.55 
 
 
238 aa  54.7  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000155742  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0277  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.48 
 
 
336 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>