87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3620 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  100 
 
 		 141 aa  283  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  47.01 
 
 		 218 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  43.08 
 
 		 182 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  41.54 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  47.83 
 
 		 208 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  42.4 
 
 		 162 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  48.28 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  44 
 
 		 193 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  42.4 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  43.75 
 
 		 246 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  34.44 
 
 		 170 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  40.52 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  39.47 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  49.11 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  36.36 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  35.71 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  36.21 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  34.06 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  35.9 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2786  Allergen V5/Tpx-1 related  43.48 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  35.96 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  37.39 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  37.39 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  33.63 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  36 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  31.9 
 
 		 541 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  35.34 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  35 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.34 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  35.19 
 
 		 331 aa  54.3  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0159  SCP-like extracellular  34.78 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  0.78157 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  33.04 
 
 		 328 aa  53.5  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  32.14 
 
 		 245 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  33 
 
 		 276 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  26.62 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  40.19 
 
 		 254 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  38.38 
 
 		 296 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  29.57 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  29.57 
 
 		 347 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.25 
 
 		 321 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5377  SCP-like extracellular  29.27 
 
 		 168 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  0.43557 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.82 
 
 		 300 aa  50.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  28.57 
 
 		 335 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.3 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4832  SCP-like extracellular  28.46 
 
 		 142 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.627735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  31 
 
 		 270 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  31 
 
 		 275 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  33 
 
 		 244 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  31 
 
 		 263 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  31 
 
 		 275 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  31 
 
 		 275 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  40 
 
 		 495 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  31 
 
 		 275 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  31 
 
 		 275 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  31 
 
 		 275 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  29.09 
 
 		 264 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  31 
 
 		 270 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4345  SCP-like extracellular  29.92 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  35.34 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.34 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  33.01 
 
 		 232 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5299  SCP-like extracellular  37.04 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  30.83 
 
 		 338 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  32.99 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  30.77 
 
 		 280 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  37.04 
 
 		 264 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  40.35 
 
 		 209 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  30.09 
 
 		 270 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  28.89 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  32.28 
 
 		 317 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  30.7 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  29.27 
 
 		 353 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21450  SCP-like extracellular  28.69 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  31.03 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  28.89 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  31.03 
 
 		 165 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  31.48 
 
 		 212 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.58 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  25.42 
 
 		 242 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  26.4 
 
 		 235 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 168 aa  40.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  33.03 
 
 		 305 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3166  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.48 
 
 		 461 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1912  Allergen V5/Tpx-1 related  32.22 
 
 		 264 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  34 
 
 		 249 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>