88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3326 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  79.25 
 
 		 476 aa  758    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  96.23 
 
 		 478 aa  917    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  100 
 
 		 478 aa  971    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  41.91 
 
 		 474 aa  302  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  31.43 
 
 		 400 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  30.54 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  26.99 
 
 		 485 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  37.24 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  39.17 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  36.82 
 
 		 392 aa  143  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  36.82 
 
 		 392 aa  143  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  29.78 
 
 		 475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  35.92 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  29.46 
 
 		 475 aa  140  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  32.13 
 
 		 391 aa  140  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  36.86 
 
 		 386 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  37.16 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  35.92 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  36.78 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  36.78 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  34.69 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  34.69 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  34.91 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  34.13 
 
 		 501 aa  126  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  26.95 
 
 		 501 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  32.37 
 
 		 389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  25.56 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  29.49 
 
 		 389 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  32.02 
 
 		 398 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  37.58 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  29.44 
 
 		 397 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  28.27 
 
 		 396 aa  94.4  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  27 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  28.35 
 
 		 391 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  28.35 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  27.23 
 
 		 390 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  37.66 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  28.35 
 
 		 389 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  36.36 
 
 		 389 aa  90.9  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  36.36 
 
 		 389 aa  90.5  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  27.45 
 
 		 389 aa  89  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  27.12 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  35.71 
 
 		 390 aa  87  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  30.13 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  35.71 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  27.12 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  27.12 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  26.86 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  34.39 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  26.03 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  33.75 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  33.75 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  38.93 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  33.12 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  33.12 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  39.76 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  39.76 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2334  phage tail sheath protein  36.42 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  29.34 
 
 		 585 aa  64.3  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  30.22 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4130  hypothetical protein  29.8 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.277985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  30 
 
 		 660 aa  57  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  27.48 
 
 		 485 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 428 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.903684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  25.1 
 
 		 401 aa  53.9  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  25.87 
 
 		 509 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  26.61 
 
 		 596 aa  53.5  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  26.8 
 
 		 544 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  26.46 
 
 		 521 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  27.03 
 
 		 522 aa  50.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  24.49 
 
 		 521 aa  50.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  29.51 
 
 		 638 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  25.45 
 
 		 724 aa  50.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  25 
 
 		 522 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  44.44 
 
 		 603 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2043  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.25 
 
 		 248 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751057  normal  0.823629 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  24.43 
 
 		 821 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  29.23 
 
 		 599 aa  47.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3758  hypothetical protein  42.31 
 
 		 1074 aa  47.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207079  normal  0.135364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  24.49 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  28.57 
 
 		 465 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  26.67 
 
 		 697 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2527  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.86 
 
 		 847 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  30.28 
 
 		 521 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  30.28 
 
 		 521 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2752  hypothetical protein  27.54 
 
 		 288 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  22.45 
 
 		 518 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2137  hypothetical protein  41.57 
 
 		 308 aa  43.5  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.534217  normal  0.49056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>