129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1199 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1199  methyltransferase type 11  100 
 
 		 286 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0650  hypothetical protein  91.18 
 
 		 272 aa  513  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5944  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  51.02 
 
 		 230 aa  53.1  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 201 aa  52.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  30.63 
 
 		 351 aa  52.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.9 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  28.3 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 199 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  35.71 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1319  methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6510  methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2168  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.49 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6101  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 320 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 199 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 224 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  32.38 
 
 		 360 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5945  methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 677 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 264 aa  49.3  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  25.11 
 
 		 206 aa  48.9  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.79 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  27.61 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  30.68 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  48.84 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 		 356 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 355 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  22.75 
 
 		 202 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.21 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  34.88 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  32.63 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 196 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.97 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23400  16S RNA G1207 methylase RsmC  30.64 
 
 		 411 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.498455  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.95 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3637  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.64 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  45.28 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 226 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  30.47 
 
 		 353 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.25 
 
 		 232 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  29.75 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_342  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase, methyltransferase type 12  26.76 
 
 		 255 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0343727  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  23.93 
 
 		 204 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  23.93 
 
 		 204 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4911  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.51 
 
 		 270 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.168902 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2508  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.12 
 
 		 394 aa  46.2  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  31.15 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 200 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  29.41 
 
 		 291 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 200 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  32.54 
 
 		 413 aa  45.8  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  28.8 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  26.56 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  31.43 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  26.4 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  36.59 
 
 		 535 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0321  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  24.56 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.943946  normal  0.235665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.94 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 187 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  28.35 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0378  methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00156653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.95 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  24.04 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  28.35 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 343 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  24.5 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.64 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  37.31 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  26.81 
 
 		 357 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  22.7 
 
 		 204 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  26.81 
 
 		 357 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  30 
 
 		 199 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  25.75 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  27.69 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  25.53 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2897  O-methyltransferase family 3  30.37 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.262328 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>