61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5465 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  37.45 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  35.66 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  35.82 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  102  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  35.06 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  36.58 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  32.97 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  34.27 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  33.82 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6251  hypothetical protein  27.39 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  28.97 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  32.84 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  31.48 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  30.28 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  28.29 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  29 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  29.92 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  33.49 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  28.42 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  29.33 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  32.95 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  32.34 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  32.54 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  32.54 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  32.54 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  29.89 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  28.77 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  27.13 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  31.7 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  27.56 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  30.1 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18440  hypothetical protein  27.85 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.59801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  31.88 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  25.17 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  33.79 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  34.4 
 
 		 750 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1682  hypothetical protein  31.66 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 379 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1322  hypothetical protein  34.51 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  29.79 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  31.14 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  29.89 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  35.11 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  28.96 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  34.46 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  29.89 
 
 		 285 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6185  hypothetical protein  27.31 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  23.83 
 
 		 296 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  30.48 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  32.2 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  25.1 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  28.73 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  29.15 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  28.8 
 
 		 504 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  28.49 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  30.63 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  31.66 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  27.57 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  26.67 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0097  hypothetical protein  29.17 
 
 		 263 aa  42  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>