More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5139 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  100 
 
 		 178 aa  353  6.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  82.02 
 
 		 178 aa  298  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  73.33 
 
 		 180 aa  258  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  72.63 
 
 		 179 aa  257  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  71.11 
 
 		 180 aa  256  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  70.22 
 
 		 178 aa  252  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  70.39 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  68.72 
 
 		 179 aa  250  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  69.1 
 
 		 178 aa  248  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  70.39 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  68.54 
 
 		 178 aa  247  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  66.48 
 
 		 179 aa  247  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  68.72 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  68.72 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  68.54 
 
 		 178 aa  244  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  65.73 
 
 		 178 aa  244  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  67.42 
 
 		 177 aa  243  8e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  67.04 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  66.48 
 
 		 180 aa  240  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 		 179 aa  240  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  66.48 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  65.36 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  65.17 
 
 		 178 aa  235  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  64.25 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 		 180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  63.69 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  63.24 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  64.8 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  65.17 
 
 		 178 aa  228  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  61.67 
 
 		 180 aa  213  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 		 179 aa  207  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  56.18 
 
 		 180 aa  207  6e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 178 aa  203  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  57.3 
 
 		 181 aa  203  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 178 aa  201  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  201  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  58.86 
 
 		 177 aa  200  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  53.93 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 178 aa  198  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1852  50S ribosomal protein L6  57.4 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.668423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  55.37 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 180 aa  194  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  194  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  194  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  55.43 
 
 		 177 aa  193  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  53.51 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0266  ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  52.05 
 
 		 182 aa  190  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 178 aa  190  7e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  55.14 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  52.97 
 
 		 187 aa  187  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  56 
 
 		 177 aa  187  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1722  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 179 aa  187  9e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0239785  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  50.56 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>