More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5111 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  81.25 
 
 		 235 aa  384  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  77.03 
 
 		 236 aa  356  1.9999999999999998e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  76.13 
 
 		 238 aa  355  3.9999999999999996e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  75 
 
 		 236 aa  353  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  80.8 
 
 		 237 aa  350  8.999999999999999e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  74.77 
 
 		 238 aa  348  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  74.89 
 
 		 238 aa  346  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  75.45 
 
 		 238 aa  343  8e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  79.02 
 
 		 237 aa  340  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  72.65 
 
 		 235 aa  339  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  72.32 
 
 		 259 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  74.44 
 
 		 238 aa  336  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  68.75 
 
 		 238 aa  335  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  68.3 
 
 		 238 aa  335  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  70.98 
 
 		 237 aa  332  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  69.2 
 
 		 236 aa  330  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  72.89 
 
 		 230 aa  329  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  69.06 
 
 		 239 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  73.09 
 
 		 235 aa  324  6e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  73.09 
 
 		 235 aa  324  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  74.11 
 
 		 239 aa  320  8e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  71.43 
 
 		 238 aa  320  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  71.75 
 
 		 235 aa  316  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  71.75 
 
 		 235 aa  316  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  69.06 
 
 		 239 aa  316  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  71.75 
 
 		 235 aa  316  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  66.96 
 
 		 231 aa  315  4e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  70.85 
 
 		 237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  66.52 
 
 		 230 aa  311  4.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5115  50S ribosomal protein L1  70.85 
 
 		 239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10654  50S ribosomal protein L1  70.85 
 
 		 235 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0559095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  68.75 
 
 		 237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  66.07 
 
 		 259 aa  301  8.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17280  50S ribosomal protein L1  72.12 
 
 		 235 aa  300  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6060  50S ribosomal protein L1  66.07 
 
 		 237 aa  299  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  68.16 
 
 		 239 aa  299  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1113  ribosomal protein L1  70.62 
 
 		 238 aa  295  4e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  61.43 
 
 		 235 aa  287  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  58.48 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  59.55 
 
 		 231 aa  274  6e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  59.55 
 
 		 233 aa  271  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  57.01 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 230 aa  267  8.999999999999999e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 230 aa  267  8.999999999999999e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 230 aa  267  8.999999999999999e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  58.3 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  60.99 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  57.85 
 
 		 229 aa  265  5e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  58.04 
 
 		 236 aa  264  8.999999999999999e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  54.71 
 
 		 231 aa  263  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 233 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  60.27 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 230 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 230 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 230 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 230 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 230 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 230 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 230 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  60.27 
 
 		 230 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  54.95 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  59.38 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 231 aa  258  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  53.1 
 
 		 242 aa  258  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  57.59 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  52.91 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  59.05 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  57.4 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  51.12 
 
 		 235 aa  255  5e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  56.7 
 
 		 229 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  54.75 
 
 		 234 aa  254  5e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  54.75 
 
 		 229 aa  254  6e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 233 aa  254  8e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  54.55 
 
 		 231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  56.7 
 
 		 229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  56.11 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  55.16 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  55.61 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  55.66 
 
 		 232 aa  252  3e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  54.63 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 229 aa  251  7e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 227 aa  251  7e-66  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  58.64 
 
 		 229 aa  251  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 234 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  52.47 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  52.47 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  52.47 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0846  50S ribosomal protein L1  53.81 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.408948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>