More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4129 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4129  two component transcriptional regulator, LytTR family  100 
 
 		 271 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  53.85 
 
 		 264 aa  245  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12140  response regulator of the LytR/AlgR family  53.23 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  47.23 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  46.77 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  48.96 
 
 		 249 aa  204  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  47.13 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  46.91 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  46.41 
 
 		 244 aa  195  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3172  two component transcriptional regulator, LytTR family  47.67 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00901875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4560  response regulator receiver protein  46.33 
 
 		 269 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4280  response regulator receiver protein  46 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4051  response regulator receiver protein  45.6 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4126  response regulator receiver protein  45.6 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.408771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  41.06 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.41 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1153  two component transcriptional regulator, LytTR family  45.42 
 
 		 299 aa  185  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2143  response regulator receiver protein  45.49 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3377  two component transcriptional regulator, LytTR family  47.58 
 
 		 319 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  42.46 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0067  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.95 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1065  response regulator receiver protein  41.39 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.725191 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.55 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  35.02 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  33.33 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.92 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.46 
 
 		 268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3670  LytR/AlgR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  37.04 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  40.59 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.24 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 240 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  35.68 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.76 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  36.33 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.82 
 
 		 240 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  34.14 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3790  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.64 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540237  normal  0.0384587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  35.03 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.3 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1841  response regulator receiver  30.38 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.91 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  32.12 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  33.2 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4084  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.38 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.445273  normal  0.0209217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.09 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1712  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3096  response regulator receiver protein  37.2 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 254 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 236 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  31.28 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.87 
 
 		 251 aa  116  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1226  LytTR family two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.91 
 
 		 253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  29.27 
 
 		 236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.42 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.07 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.64 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4524  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.48 
 
 		 240 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000306542  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  35.81 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  31.14 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0733  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.86 
 
 		 243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  32.63 
 
 		 268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  27.05 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  29.92 
 
 		 246 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.66 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 243 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 243 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.05 
 
 		 243 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4134  LytTR family two component transcriptional regulator  31.71 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291369  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1679  LytTR family two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  29.51 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  29.51 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  29.1 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  29.51 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0036  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  29.51 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.38 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  29.51 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  26.78 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  26.78 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4846  LytTR family two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.568582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>