More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3041 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3041  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
269 aa  537  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0715  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
285 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00980  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.36 
 
 
279 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4462  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 
277 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2789  alpha/beta hydrolase fold protein  33.8 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0928  alpha/beta hydrolase fold protein  37.92 
 
 
285 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.911189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2223  alpha/beta hydrolase fold  34.36 
 
 
286 aa  115  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  45.1 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37370  predicted protein  34.86 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.273183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  28.57 
 
 
387 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  41.12 
 
 
324 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.09 
 
 
387 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.61 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  36.76 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  42.05 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
270 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
302 aa  62  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  39.64 
 
 
315 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  24.77 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  28.2 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  37.62 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
298 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.39 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
306 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
306 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 
248 aa  59.7  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 
281 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 
349 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
273 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  26.36 
 
 
301 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  23.14 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2695  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0224945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  38.38 
 
 
317 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  28.14 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.27 
 
 
313 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  39.45 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  44.87 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.8 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.8 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  24.9 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  36.94 
 
 
315 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
272 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.02 
 
 
2762 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 
299 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  26.35 
 
 
494 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 
292 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 
303 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 
310 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  38.38 
 
 
308 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  37.37 
 
 
309 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
301 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 
272 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
269 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
289 aa  55.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
303 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  35.09 
 
 
301 aa  55.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  35.78 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 
322 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  26.87 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.36 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
323 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  27.18 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8516  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.97 
 
 
337 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
376 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  28.3 
 
 
293 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>