More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2609 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 178 aa  348  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  64.38 
 
 		 198 aa  184  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  65.71 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  62.04 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  62.12 
 
 		 193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  59.29 
 
 		 203 aa  153  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  58.57 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  56.34 
 
 		 193 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  52.14 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  55.64 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  53.44 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  46.07 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  53.38 
 
 		 240 aa  122  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  57.5 
 
 		 200 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  50.76 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  49.66 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  54.55 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  47.66 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  48.46 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  46.09 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  48.84 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  44.85 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  46.58 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  41.61 
 
 		 234 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  44.85 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  50 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  50 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  50 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  47.73 
 
 		 193 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  48.48 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  49.24 
 
 		 206 aa  101  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  55.38 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  44.52 
 
 		 212 aa  97.4  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  46.94 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  44.19 
 
 		 228 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  44.36 
 
 		 202 aa  94.4  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  40.24 
 
 		 237 aa  90.9  8e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  41.86 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  41.86 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  36.97 
 
 		 236 aa  87.8  8e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  43.61 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.96 
 
 		 382 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 244 aa  81.3  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  35.98 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  41.54 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  40.15 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  40.29 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 		 447 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 224 aa  72  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  37.33 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.18 
 
 		 369 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  39.66 
 
 		 440 aa  70.9  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  34.87 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  48.31 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  40.56 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  46.07 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  39.69 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.05 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 448 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  39.69 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 363 aa  68.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  39.69 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.21 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.21 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 448 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 226 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.85 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  41.05 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.41 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  41.48 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.12 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 402 aa  65.1  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.12 
 
 		 378 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.72 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  37.59 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  41.35 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.72 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>