More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2154 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  100 
 
 		 562 aa  1093    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  58.72 
 
 		 566 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  57.64 
 
 		 548 aa  558  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2616  ABC transporter related  55.83 
 
 		 540 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  49 
 
 		 600 aa  452  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  49.63 
 
 		 553 aa  419  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  47.72 
 
 		 552 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  46.73 
 
 		 548 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  48.13 
 
 		 509 aa  373  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.047738  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  40.62 
 
 		 554 aa  333  4e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  41 
 
 		 537 aa  293  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  40.94 
 
 		 564 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 563 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1063  ABC transporter related protein  50.92 
 
 		 671 aa  261  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  38.56 
 
 		 561 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.7 
 
 		 583 aa  257  4e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  37.19 
 
 		 563 aa  257  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  41.24 
 
 		 536 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  40.58 
 
 		 603 aa  250  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0909  ABC transporter related  42.7 
 
 		 563 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.19 
 
 		 585 aa  230  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  37.9 
 
 		 546 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  31.61 
 
 		 547 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  37.85 
 
 		 551 aa  221  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  40.97 
 
 		 550 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.39 
 
 		 555 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.96 
 
 		 550 aa  200  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  40.5 
 
 		 551 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  35.06 
 
 		 537 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  28.09 
 
 		 535 aa  193  8e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 635 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 635 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 635 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 635 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  34.61 
 
 		 550 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  30.67 
 
 		 663 aa  189  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  32 
 
 		 635 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.17 
 
 		 635 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  30.67 
 
 		 663 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  34.9 
 
 		 553 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  33.45 
 
 		 542 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  34.9 
 
 		 553 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  34.9 
 
 		 553 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  33.89 
 
 		 569 aa  187  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  32.74 
 
 		 545 aa  187  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.33 
 
 		 637 aa  187  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.88 
 
 		 635 aa  186  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  32.78 
 
 		 545 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.17 
 
 		 637 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03121  ABC transporter ATP-binding protein  27.74 
 
 		 530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  29.24 
 
 		 685 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.78 
 
 		 637 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.17 
 
 		 637 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  35.78 
 
 		 548 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  34.55 
 
 		 554 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  31.17 
 
 		 637 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  31.17 
 
 		 637 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.17 
 
 		 637 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 		 640 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  31.17 
 
 		 637 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.17 
 
 		 637 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.17 
 
 		 637 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  28.44 
 
 		 540 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 		 640 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 		 640 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  28.62 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  28.62 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0877  ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  28.62 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00804  hypothetical protein  28.62 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2744  ABC transporter related  33.9 
 
 		 609 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  33.58 
 
 		 544 aa  182  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  28.44 
 
 		 641 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  32.1 
 
 		 625 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  34.35 
 
 		 615 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  28.44 
 
 		 530 aa  182  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  32 
 
 		 639 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  30.95 
 
 		 657 aa  181  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.59 
 
 		 634 aa  180  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  31.9 
 
 		 648 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  32.2 
 
 		 541 aa  180  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1049  ABC transporter, ATP-binding protein  28.6 
 
 		 513 aa  179  8e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2480  ABC transporter-related protein  31.41 
 
 		 676 aa  180  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  29.28 
 
 		 667 aa  179  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  36.76 
 
 		 543 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  27.04 
 
 		 532 aa  179  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  33.71 
 
 		 672 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  28.68 
 
 		 644 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.89 
 
 		 532 aa  178  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  27.06 
 
 		 532 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  32.14 
 
 		 650 aa  179  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  27.57 
 
 		 518 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  31.75 
 
 		 652 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4130  ABC transporter related  29.78 
 
 		 533 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  30.84 
 
 		 690 aa  178  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1880  ABC transporter ATPase  34.54 
 
 		 532 aa  177  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.548476  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1682  ABC transporter related protein  32.64 
 
 		 532 aa  177  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>