More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0901 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  100 
 
 		 239 aa  474  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  55.93 
 
 		 241 aa  245  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  55.79 
 
 		 238 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  52.3 
 
 		 238 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  52 
 
 		 228 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  48.91 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  50.22 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  50.22 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  50.22 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  49.57 
 
 		 246 aa  204  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  47.98 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  52.65 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  45.41 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  44.54 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  45.76 
 
 		 249 aa  181  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  47.37 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  47.09 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  50 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  46.22 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  46.29 
 
 		 250 aa  167  9e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  46.58 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  42.6 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  43.72 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  46.19 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  41.67 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  40 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  43.93 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  38.1 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  38.66 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  38.89 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  37.6 
 
 		 255 aa  128  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  38.4 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  40.09 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  38.4 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  38.4 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  38.4 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  38.4 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  43.36 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  33.11 
 
 		 321 aa  125  6e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  34.11 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  37.14 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  34.5 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  35.62 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  39.08 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  33.63 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  40.69 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  33.99 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  39.92 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  33.87 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  34.16 
 
 		 270 aa  121  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  38.66 
 
 		 264 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  30.45 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  32.41 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  38.79 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  31.54 
 
 		 271 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  34.47 
 
 		 244 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  37.25 
 
 		 243 aa  118  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  38.43 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  32.41 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  37.25 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  32.8 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  36.36 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  37.35 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  37.35 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  36.55 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  37.35 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  37.35 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  32.92 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  37 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  32.63 
 
 		 248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  36.6 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  37.45 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  34.63 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  37.61 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  39.91 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  35.5 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  36.95 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  35.68 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  36.95 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  36.05 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  35.68 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  29 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  33.06 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  35.75 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  35.98 
 
 		 283 aa  115  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  37.1 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  34.41 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  32.75 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  35.98 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  33.91 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  33.62 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  38.24 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  37.77 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  33.77 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  36.17 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  41.67 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  30.98 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  31.02 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  34.47 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  34.32 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>