More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3248 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  72.31 
 
 		 197 aa  285  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  68.45 
 
 		 203 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  68.45 
 
 		 203 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  66.83 
 
 		 208 aa  285  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  71.79 
 
 		 220 aa  284  7e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  71.28 
 
 		 197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  71.28 
 
 		 197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  71.28 
 
 		 197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  71.28 
 
 		 197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  71.28 
 
 		 220 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  71.07 
 
 		 204 aa  279  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  66.02 
 
 		 203 aa  276  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  65.38 
 
 		 205 aa  269  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  71.27 
 
 		 180 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  66.18 
 
 		 209 aa  259  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  62.81 
 
 		 200 aa  250  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  61.93 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  63.08 
 
 		 199 aa  248  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  62.12 
 
 		 199 aa  248  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  58.29 
 
 		 212 aa  238  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  63.19 
 
 		 181 aa  228  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  59.62 
 
 		 208 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  58.2 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  55.5 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  57.29 
 
 		 224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  58.65 
 
 		 205 aa  218  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  55.35 
 
 		 215 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  59.47 
 
 		 205 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  58.82 
 
 		 206 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  57 
 
 		 213 aa  206  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  52.09 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  56.28 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  58.22 
 
 		 217 aa  201  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  54.79 
 
 		 213 aa  197  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  52.38 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  53.02 
 
 		 211 aa  194  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  48.62 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  53 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  46.75 
 
 		 244 aa  179  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  49.75 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  43.14 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  37.56 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  35.78 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  37.04 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  34.78 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  37.04 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  35.14 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  36.07 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  36.07 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  35.14 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  34.3 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  34.9 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  34.8 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  34.39 
 
 		 206 aa  105  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  37.84 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  35.48 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  38.78 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  38.78 
 
 		 295 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  33.15 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  31.09 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  34.66 
 
 		 298 aa  97.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.95 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.95 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  38.1 
 
 		 295 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  38.1 
 
 		 295 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  34.29 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  40.77 
 
 		 296 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  33.66 
 
 		 743 aa  96.3  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  36 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  36.51 
 
 		 292 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  33.52 
 
 		 283 aa  94.7  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  36.51 
 
 		 292 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  36.05 
 
 		 298 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  34.39 
 
 		 285 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 285 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1293  cytochrome c oxidase, subunit III  30.68 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000775501  hitchhiker  0.00406626 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  33.71 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5106  cytochrome c oxidase, subunit III  33.52 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0670031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  41.22 
 
 		 294 aa  92  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  31.28 
 
 		 201 aa  91.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2032  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.29 
 
 		 209 aa  91.7  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  39.35 
 
 		 279 aa  91.7  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  40.46 
 
 		 295 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  32.8 
 
 		 284 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  40.46 
 
 		 295 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  39.06 
 
 		 289 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  39.06 
 
 		 289 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  32.28 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  32.35 
 
 		 291 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  33.66 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  39.23 
 
 		 291 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.77 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  32.77 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 287 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0660  cytochrome c oxidase subunit III  32.96 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.833794  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  30.81 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  32.8 
 
 		 284 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  34.39 
 
 		 285 aa  89  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>