More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3035 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  100 
 
 
286 aa  568  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  69.58 
 
 
276 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  66.01 
 
 
282 aa  347  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  63.88 
 
 
274 aa  343  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  63.7 
 
 
283 aa  340  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  65.77 
 
 
269 aa  339  4e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  63.64 
 
 
268 aa  328  8e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  63.35 
 
 
316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  61.33 
 
 
362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  60.71 
 
 
262 aa  314  9e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  61.96 
 
 
284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  55.48 
 
 
304 aa  305  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  60.24 
 
 
265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  58.87 
 
 
278 aa  296  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  59.84 
 
 
266 aa  291  8e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  61.45 
 
 
277 aa  285  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  58.24 
 
 
299 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  59.27 
 
 
274 aa  277  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  55.73 
 
 
293 aa  272  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  52.65 
 
 
269 aa  270  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  53.31 
 
 
276 aa  259  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  52.17 
 
 
300 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  38.36 
 
 
256 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  35.53 
 
 
266 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  27.43 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  36.56 
 
 
236 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  31.54 
 
 
264 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.74 
 
 
236 aa  86.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  34.59 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.1 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  44.35 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  35.57 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  26.78 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
242 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  30.09 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  29.91 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  44.54 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  26.27 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  41.46 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  47.52 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.07 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  41.46 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  31.09 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  30.41 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.46 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.88 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  30.41 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  41.46 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  34.85 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  29.69 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  29.48 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  31.88 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  30.77 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  29.61 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  32.78 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.54 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  41.96 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  29.82 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.54 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  29.17 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  43.27 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  33.15 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  30.58 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  33.15 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  33.15 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  33.15 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  33.15 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  24.03 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  35.85 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  33.15 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  36.31 
 
 
272 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  24.03 
 
 
251 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  27.51 
 
 
243 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  43.81 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  26.82 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  30 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  25.54 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  44.34 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  23.64 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4070  methyltransferase type 11  32.09 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  0.0929931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  30.92 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.92 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  26.23 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  30.92 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  30.92 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  31.49 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  30.92 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  30.92 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  27.49 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  24.03 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>