More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2541 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  100 
 
 
399 aa  816    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  91.69 
 
 
409 aa  768    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  71.57 
 
 
425 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  73.08 
 
 
418 aa  572  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  70.54 
 
 
421 aa  552  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  69.43 
 
 
431 aa  545  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  68.99 
 
 
436 aa  539  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  63.29 
 
 
430 aa  501  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  56.71 
 
 
396 aa  441  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  56.56 
 
 
389 aa  435  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.73 
 
 
393 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  56.6 
 
 
398 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  55.93 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  55.67 
 
 
405 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  55.67 
 
 
405 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  55.13 
 
 
393 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  54.62 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  54.31 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  53.35 
 
 
391 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  53.23 
 
 
387 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  51.16 
 
 
388 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  52.62 
 
 
406 aa  373  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  49.39 
 
 
426 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  48.42 
 
 
409 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  52.74 
 
 
410 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  51.95 
 
 
382 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  52.31 
 
 
368 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  52.71 
 
 
380 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  50.9 
 
 
375 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  51.29 
 
 
381 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.12 
 
 
406 aa  362  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  51.38 
 
 
404 aa  361  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  50.52 
 
 
370 aa  360  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  48.84 
 
 
372 aa  360  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  51.54 
 
 
380 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  51.55 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.62 
 
 
376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  48.36 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  49.5 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  48.71 
 
 
370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  49.87 
 
 
388 aa  351  1e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  49.11 
 
 
374 aa  350  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  49.35 
 
 
375 aa  349  4e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  49.87 
 
 
375 aa  348  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  48.83 
 
 
375 aa  347  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  49.1 
 
 
366 aa  347  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  50.5 
 
 
404 aa  346  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  48.85 
 
 
370 aa  346  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.22 
 
 
349 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 
369 aa  345  6e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  47.63 
 
 
363 aa  345  8e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  50.78 
 
 
360 aa  344  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  49.35 
 
 
364 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  48.56 
 
 
367 aa  343  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  46.17 
 
 
369 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  48.32 
 
 
368 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  47.42 
 
 
370 aa  343  4e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  48.46 
 
 
363 aa  342  5e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.74 
 
 
379 aa  342  5e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  47.68 
 
 
364 aa  342  5.999999999999999e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  48.6 
 
 
398 aa  342  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  47.94 
 
 
364 aa  342  7e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  47.93 
 
 
365 aa  342  9e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  47.94 
 
 
364 aa  341  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  47.44 
 
 
366 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  47.3 
 
 
365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  47.33 
 
 
382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  47.68 
 
 
364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  47.3 
 
 
365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  50 
 
 
363 aa  339  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  46.56 
 
 
366 aa  339  5.9999999999999996e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  46.56 
 
 
366 aa  339  5.9999999999999996e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  47.57 
 
 
365 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  49.36 
 
 
359 aa  337  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  46.37 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  47.44 
 
 
366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  45.94 
 
 
370 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  46.43 
 
 
374 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  47.93 
 
 
367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  46.52 
 
 
384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  45.6 
 
 
365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  49.12 
 
 
379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  47.03 
 
 
383 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  51.43 
 
 
393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.56 
 
 
367 aa  335  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  47.24 
 
 
367 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  47.67 
 
 
367 aa  335  7e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  50 
 
 
360 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.92 
 
 
349 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.44 
 
 
366 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.18 
 
 
365 aa  334  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  46.43 
 
 
372 aa  334  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  46.25 
 
 
381 aa  333  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.27 
 
 
379 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  50.64 
 
 
353 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  48.72 
 
 
366 aa  333  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  49.61 
 
 
360 aa  333  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  48.68 
 
 
362 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  49.09 
 
 
358 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5799  ABC transporter related protein  50.26 
 
 
398 aa  333  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.171688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>