More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1159 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  48.52 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  43.9 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  41.39 
 
 
244 aa  185  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  41.39 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  42.62 
 
 
297 aa  178  5.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  38.15 
 
 
256 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  40.43 
 
 
251 aa  159  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  30.93 
 
 
323 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  34.72 
 
 
251 aa  95.5  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  32.27 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  30.74 
 
 
322 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 
255 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  29.2 
 
 
280 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  27.94 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  29.79 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  28.4 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 
251 aa  82  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  29.63 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  31.28 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  32.84 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.66 
 
 
250 aa  79  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  27.44 
 
 
318 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0186  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000106094  normal  0.0583426 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0988  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  28.35 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  28.35 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  28.35 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  23.22 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  28.35 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  28.35 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  31.29 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 
319 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  27.63 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  32.52 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  33 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  33 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  33 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  32.11 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  31.29 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  26.49 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  30.61 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  29.36 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  29.36 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  29.36 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  29.36 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  28.9 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  27.97 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  27.76 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  28.9 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  24.6 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  28.69 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  26.43 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  26.71 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  28.9 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  26.59 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  28.9 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  30.52 
 
 
322 aa  72  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  31.13 
 
 
305 aa  72  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 
265 aa  72  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  24.34 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  30.98 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  29.8 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  25 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  31.22 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  22.96 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  26.02 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  24.55 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  25.34 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  26.64 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  25.85 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  21.8 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  24.37 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  24.37 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  24.37 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  24.73 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  24.37 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.9 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  24.37 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>