More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0302 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  100 
 
 		 282 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  48.04 
 
 		 281 aa  276  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  45.45 
 
 		 279 aa  259  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  40.35 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  39.36 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 252 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  39.22 
 
 		 225 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  43.08 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  30.26 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  29.71 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  39.53 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  41.35 
 
 		 154 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1659  signal transduction protein  28.25 
 
 		 660 aa  85.5  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  37.86 
 
 		 145 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  36.17 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  40.77 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  39.39 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  28.02 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  28.24 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  28.62 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  39.39 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  27.1 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  31.09 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  39.1 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  37.9 
 
 		 885 aa  78.2  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  29.73 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  27.01 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  36.92 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  34.85 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  35.14 
 
 		 185 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  22.91 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  34.42 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  34.92 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  34.92 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  34.92 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  33.81 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  35.61 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  32.62 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  25.9 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.59 
 
 		 903 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  33.08 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  31.82 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  33.86 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  25.18 
 
 		 283 aa  72  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  32.31 
 
 		 252 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  34.35 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  26.51 
 
 		 423 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  31.3 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  33.08 
 
 		 145 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  37.3 
 
 		 141 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 		 863 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  28.36 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1271  signal transduction protein  25.63 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.906703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  28 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  33.06 
 
 		 867 aa  71.2  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  32.9 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  34.59 
 
 		 140 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  38.02 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.57 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  36.09 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  24.64 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  34.92 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.62 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  28.93 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 605 aa  70.1  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.62 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  35.82 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  38.89 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  34.85 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  26.32 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  29.44 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  27.69 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0521  diguanylate cyclase  30.37 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  30.53 
 
 		 513 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  30.53 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1716  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.65 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.626692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  31.35 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 		 688 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  31.78 
 
 		 877 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1618  signal transduction protein  25.24 
 
 		 656 aa  68.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  30.88 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  26.88 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  22.89 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.39 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  35.29 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  33.85 
 
 		 614 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>